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ScerTF
ScerTF
| Titel: | ScerTF |
| Identifier: | http://stormo.wustl.edu/ScerTF/ |
| Autor: | Washington University / Department of Genetics / Stormo Lab |
| Zusammenfassung: | ScerTF katalogisiert über 1200 Positions-Gewichtsmatrizen (PWMs) für 196 verschiedene Hefe-Transkriptionsfaktoren. Wir haben 11 Literaturquellen kuratiert, die veröffentlichten positionsspezifischen Scoring-Matrizen gegen In-vivo-TF-Besetzungsdaten und TF-Zerstörungs-Experimente bewertet und die genauesten Modelle kombiniert, um eine einzige Sammlung der am besten performenden Gewichtsmatrizen für Saccharomyces cerevisiae zu produzieren. ScerTF ist nützlich für eine Vielzahl von Problemen, wie die Verknüpfung regulatorischer Stellen mit Transkriptionsfaktoren, Identifizierung eines Transkriptionsfaktors auf einer Benutzereingabe-Matrix, das Auffinden der Gene von einem bestimmten TF gebunden bzw. reguliert und das Finden regulatorischer Wechselwirkungen zwischen Transkriptionsfaktoren. Geben Sie einen TF-Namen ein, um die empfohlene Matrix für einen bestimmten TF zu finden oder geben Sie eine Nukleotidsequenz ein, um alle TFs zu identifizieren, die an eine bestimmte Region binden. [Information des Anbieters, übersetzt] |
| Thema: |
Biochemische Genetik der Pflanzen und Mikroorganismen (572.82)
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| Zielgruppe: | Experten |
| Sprache: | Englisch |
| Format: | Website; Datenbank |
| Ressourcentyp: | Fakten-Datenbanken |
| Zugang: | frei |
| Letzte Änderung des Metadatensatzes: | 14.12.2012 |
| Metadatenlieferant: |
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| URL dieses vifabio-Datensatzes: | http://www.vifabio.de/iqfBio/detail/7826 |
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