Vollanzeige:
eQuilibrator: The Biochemical Thermodynamics Calculator
Titel: eQuilibrator: The Biochemical Thermodynamics Calculator
Titel Kurzform: eQuilibrator
Identifier: http://equilibrator.weizmann.ac.il/
Autor: Weizmann Institute <Rehovot, Israel> / Milo Lab
Zusammenfassung: eQuilibrator ist ein einfaches Web-Interface, welches einfache thermodynamische Analysen von biochemischen Systemen ermöglichen soll. eQuilibrator erlaubt eine freie Textsuche für biochemische Stoffe und Reaktionen, und bietet thermodynamische Abschätzungen für beides unter verschiedenen Bedingungen. Abschätzungen von thermodynamischen Parametern (ΔrG und ΔfG) klären auf, wie viel Energie nötig ist, um eine bestimmte biochemische Reaktion voranzutreiben, und in welche Richtung diese Reaktion unter bestimmten zellulären Bedingungen ablaufen wird. Da experimentelle Messungen der freien Bildungsenergie (ΔfG°) von Stoffen technisch aufwendig sind, wurden die meisten bekannten Metabolite nicht thermodynamisch charakterisiert. eQuilibrator benutzt gut untersuchte Approximationen von ΔfG, im Speziellen der Gruppenbeitragsmethoden (Fragmentmethoden), welche es ermöglichen thermodynamische Analysen an vielen biochemischen Reaktionen und Reaktionswegen (Biochemical Pathways) durchzuführen. Momentan bietet eQuilibrator Abschätzungen für viele Stoffe aus der KEGG–Datenbank (ca. 4500). Einzelne Stoffe und Enzyme können mittels ihrer gebräuchlichen Namen (Wasser, Glucosamin, Hexokinase) gesucht werden, und Reaktionen können in einem einfachen, freien Textformat (Ribulosebisphosphat + CO2 + Wasser -> 2-3-Bisphosphoglycerat) eingegeben werden, eQuilibrator analysiert diese automatisch. eQuilibrator erlaubt es außerdem Manipulationen an den Bedingungen, wie dem pH, der Ionenstärke, sowie Reaktanden- und Produktkonzentrationen, einer Reaktion vorzunehmen um Ihnen bei der Erkundung der thermodynamischen Landschaft von biochemischen Reaktionen zu helfen. [Information des Anbieters, übersetzt]
Thema: Biophysik (571.4);
Biochemie (572)
» finde ähnliche Quellen!
Zielgruppe: Fortgeschrittene; Experten
Sprache: Englisch
Format: Website
Ressourcentyp: Thematische Websites
Zugang: frei
Letzte Änderung des Metadatensatzes: 03.01.2014
Metadatenlieferant: UBFfm
URL dieses vifabio-Datensatzes: http://www.vifabio.de/iqfBio/detail/7494
© Virtuelle Fachbibliothek Biologie (vifabio)
 Drucken Schließen