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Stanford OligoGenome
Titel: Stanford OligoGenome
Titel Kurzform: OligoGenome
Titel alternativ: Stanford Human Oligo Genome Project
Identifier: http://oligogenome.stanford.edu/
Autor: Ji, Hanlee; et al.
Zusammenfassung: Das Standord Human-Oligogenom-Projekt bietet eine Datenbank von erfassten Capture-Oligonukleotiden für die Durchführung von gezielter Hochdurchsatz-Abschnittsequenzierung des menschlichen Genoms. Dieser Satz an Capture-Oligonukleotiden deckt über 92% des humanen Genoms hg19/build 37 ab, und über 99% der kodierenden Regionen, definiert durch CCDS. Die Capture-Reaktion verwendet einen hoch gebündelten Ansatz für das selektive Zirkularisieren und Abfangen von verschiedenen genomischen Regionen durch die Verwendung der in-solution-Methode, vorgestellt in Natsoulis et al, PLoS One 2011. Kombinierte Pools von Capture-Oligonukleotiden zirkularisieren selektiv das genomische DNA-Target, gefolgt von einer spezifischen PCR-Amplifizierung von Zielregionen mit der Verwendung eines durchgängigen Primerpaares für alle der Capture-Oligonukleotiden. Im Gegensatz zu Multiplex-PCR-Methoden ist die selektive, genomische Zirkularisierung fähig, effizient Hunderte von genomischen Regionen gleichzeitig im Mehrfachbetrieb zu amplifizieren, ohne dass eine umfassende PCR-Optimierung notwendig ist oder ungewünschte Nebenprodukte auftreten. Vorzüge der selektiven Genomzirkularisierungsmethode ist die relative Robustheit dieser Technik und die günstige Synthese von Standard-Capture-Oligonukleotiden zur Auswahl genomischer Regionen. [Information des Anbieters, übersetzt]
Thema: DNS (Desoxyribonukleinsäure) (572.86)
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Zielgruppe: Experten
Sprache: Englisch
Format: Website; Datenbank
Ressourcentyp: Fakten-Datenbanken
Zugang: frei
Letzte Änderung des Metadatensatzes: 07.08.2012
Metadatenlieferant: UBFfm
URL dieses vifabio-Datensatzes: http://www.vifabio.de/iqfBio/detail/7488
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