Titel: | Hotregion: a database of predicted hot spot clusters |
Titel Kurzform: | Hotregion |
Identifier: | http://prism.ccbb.ku.edu.tr/hotregion |
Autor: | Cukuroglu, Engin; Gursoy, Attila; Keskin, Ozlem |
Zusammenfassung: | "Hot Spots sind energetisch wichtige Seitenketten auf Proteinkontaktstellen und sind nicht zufällig über die Berührungsfläche verstreut, sondern ziemlich konzentriert. Diese gebündelten Hot Spots bilden Hot Regions. Hot Regions sind wichtig für die Stabilität von Proteinkomplexen und liefern auch die Spezifität der Bindungsstellen. Wir schlagen eine Datenbank namens HotRegion vor, welche die Hot Region-Informationen der Bindungsflächen durch die Verwendung vorhergesagter Hot Spot-Seitenketten und struktureller Eigenschaften dieser Schnittstellenseitenketten wie pair potentials, accessible surface area (ASA) und relative ASA-Werte der Interface-Seitenketten von Monomer- und Komplexform des Proteins liefert. Auch die 3D-Visualisierung der Kontaktstelle und Interaktionen zwischen den Hot Spot-Seitenketten wird angeboten." (übersetzt aus: Cukuroglu E., Gursoy A., Keskin O.; HotRegion: A database of predicted hot spot clusters, Nucleic Acids Res., 2012, Vol. 40, D829–D833.) [Sonstige Quelle laut Angabe] |
Thema: |
Proteine (572.6)
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Zielgruppe: | Fortgeschrittene; Experten |
Sprache: | Englisch |
Format: | Website; Datenbank |
Ressourcentyp: | Fakten-Datenbanken |
Zugang: | frei |
Letzte Änderung des Metadatensatzes: | 07.03.2014 |
Metadatenlieferant: |
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URL dieses vifabio-Datensatzes: | http://www.vifabio.de/iqfBio/detail/7455 |
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