Titel: | SMART - Simple Modular Architecture Research Tool |
Titel Kurzform: | SMART |
Identifier: | http://smart.embl-heidelberg.de/ |
Autor: | Schultz, Jörg; et al. |
Veröffentlicht durch: | EMBL = European Molecular Biology Laboratory |
Zusammenfassung: | Sie köennen SMART in zwei verschiedenen Modi verwenden: "normal" oder "genomic". Der Hauptunterschied liegt in den jeweils zugrunde liegenden Protein-Datenbanken. In "Normal SMART" umfaßt die Datenbasis Swiss-Prot, SP-TrEMBL und stabile Ensembl-Proteome. In "Genomic SMART" werden nur die Proteome von vollständig sequenzierten Genomen verwendet, und zwar Ensembl für Metazoan und Swiss-Prot für alle Übrigen. Die vollständige Liste der Genome in "Genomic SMART" ist online verfügbar. Die Protein-Datenbank in "Normal SMART" weist Redundanz in signifikantem Ausmaß auf, wenngleich identische Proteine entfernt werden. Wollen Sie SMART für die Analyse von Domänen-Architekturen oder für die Auszählung von Domänen in verschiedenen Genomen verwenden, dann ist der Wechsel in den "Genomic mode" eine Erwägung wert. [Information des Anbieters, übersetzt] |
Thema: |
Proteine (572.6)
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Zielgruppe: | Experten |
Sprache: | Englisch |
Format: | Website; Datenbank |
Ressourcentyp: | Fakten-Datenbanken |
Zugang: | frei |
Letzte Änderung des Metadatensatzes: | 29.09.2014 |
Metadatenlieferant: | |
URL dieses vifabio-Datensatzes: | http://www.vifabio.de/iqfBio/detail/3843 |
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