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RNS (Ribonukleinsäure)
RNS (Ribonukleinsäure)
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Der Allen Brain Atlas (ABA) stellt eine interaktive und genomweite Bilddatenbank der Genexpressionsmuster im Mäusegehirn dar. Auf der Webseite sind eine Kombination von RNA In-Situ Hybridisierungsdaten, ein ausführlicher Referenzatlas und ein IT-gestütztes Analysewerkzeug integriert worden, um einen durchsuchbaren, digitalen Atlas der Genexpression bereitzustellen. Zusammengenommen bieten diese Resourcen Ihnen eine umfangreiche Online-Platform für die Erforschung des Gehirns auf zellulärer und molekularer ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken; Bild-Datenbanken
http://www.brain-map.org/
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Die Webseite der Datenbank für vergleichbare ribosomale Komplexe (DARC – Database für Aligned Ribosomal Complexes) ist ein Hilfsmittel für den direkten Vergleich der Strukturen von verfügbaren ribosomalen Komplexen.
Die Webseite bietet eine Sammlung von Dateien, die in der RCSB Proteindatenbank und der Electron Microscopy Datenbank hinterlegt sind, und die abgeglichen wurden, sodass ein direkter Vergleich der Strukturen möglich ist.
[Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://darcsite.genzentrum.lmu.de/
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Die virale siRNA Datenbank (VIRsiRNAdb) ist eine strukturelle Sammlung von experimentell bestätigten siRNAs, veröffentlicht in der wissenschaftlichen Literatur, welche auf diverse Gene von humanmedizinisch wichtigen Viren abzielen. Die Pflegebemühungen konzentrieren sich bisher hauptsächlich auf bekannte Viren, die mit bekannten Infektionskrankheiten beim Menschen in Verbindung gebracht werden. Derzeit liefert die Datenbank experimentelle Informationen von 1358 siRNAs, aus einschlägigen Pubmed-Artikeln, ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://crdd.osdd.net/servers/virsirnadb/
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In Tieren regulieren RNA-Bindungsproteine (RBP) und mikroRNA (miRNA) die Expression von förmlich allen Genen post-transkriptional durch die Bindung von RNA. Aktuelle Fortschritte in experimentellen und kombinatorischen Methoden ermöglichen das transkriptom-weite Abbilden von diesen Interaktionen. Es wird vermutet, dass die kombinatorischen Aktivitäten von RBPs und miRNAs auf Target-mRNA einen post-transkriptionalen Code bilden. Wir stellen Ihnen eine Datenbank zur Verfügung, die die Suche nach der ... [Sonstige Quelle laut Angabe]
Fakten-Datenbanken
http://dorina.mdc-berlin.de/rbp_browser/dorina.html
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Die "greengenes"-Webapplication bietet einen Zugang zu aktuellen und umfassenden 16S rRNA-Gensequenzalignments, welche durch Browsen, Analysieren und Downloaden näher betrachtet werden können.
Die Daten, die greengenes präsentiert, können Wissenschaftlern bei der Wahl phylogenetisch-spezifischer Sonden, bei der Interpretation von Microarray-Resultaten und dem Aligning/der Annotation von neuartigen Sequenzen behilflich sein. Wenn Sie ein ARB-Nutzer sind, können Sie greengenes zur Aktualisierung ihrer ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://greengenes.lbl.gov/
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JASPAR ist eine Datensammlung zu Transkriptionsfaktoren und ihren DNA-Bindungen, modelliert in Form von Matrizes. Diese können in Position Weight Matrices (PWMs or PSSMs) konvertiert werden, wie sie für das Scannen von Genomsequenzen verwendet werden.
JASPAR ist die einzige Datenbank zu diesem Themengebiet, bei der die Daten ohne Einschränkungen, das heisst nach dem Open-source-Prinzip zur Verfügung stehen. Für eine umfassende Übersicht zu den Modellen und ihren möglichen Verwendungen vergleiche ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://jaspar.genereg.net/
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Die miRBase Sequenz Datenbank ist ein durchsuchbare Datenbank mit publizierten miRNA Sequenzen und Annotationen. Die Daten hier wurden vormals von miRNA Registry bereitgestellt. Jeder Eintrag in der miRBase Sequenz Datenbank repräsentiert ein vorausgesagtes "Haarnadel" Teilstück eines miRNA Transkripts (in der Datenbank als "mir" bezeichnet), zusammen mit Informationen über den Ort und die Sequenz der reifen miRNA Sequenz (genannt "miR"). Beides, die "Hairpin" und die reifen Sequenzen sind verfügbar ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://microrna.sanger.ac.uk/sequences/
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Diese Datenbank möchte für jeden hilfreich sein, der die Rolle von microRNAs (miRNAs) in der Wachstumsphase von Pflanzen, in der Organbildung und bei der Reaktion auf verschiedene biotische und abiotische Streßreize erforschen will. Um die Datenbank zu erkunden, müssen Sie einfach auf „Browse Atlas“ klicken oder Sie können einen bestimmten miRNA-Eintrag suchen, indem Sie mindestens 2 Zahlen seiner ID in das Fenster eintragen. Detaillierte Informationen und verfügbare Features der mirEX-Datenbank ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://comgen.pl/mirex/
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miRNEST ist eine umfangreiche Sammlung von tierischen, pflanzlichen und viralen microRNA-Daten. Die Datenbank bietet Ihnen 9980 miRNA-Kandidaten von 420 Tier- und Pflanzenarten, die in Expressed Sequence Tags vorhergesagt werden, vorhergesagte Targets für Pflanzenkandidaten, RNA-Seq die Kandidaten von 29 Arten abbilden, sowie externe Daten aus 12 Datenbanken, die Sequenzen, Polymorphismus, Expression und Regulation beinhalten.
Die aktuelle Version miRNEST 1.0 enthält miRNA von 563 Tieren, Pflanzen ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://lemur.amu.edu.pl/share/php/mirnest/
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Das Ziel des Nukleinsäure-Datenbank-Projekts (NDB) ist es, strukturelle Informationen zu Nukleinsäuren zu sammeln und zu verbreiten. Das NDB wurde im Jahre 1992 durch Helen M. Berman (Rutgers University), Wilma K. Olson (Rutgers University) und David Beveridge (Wesleyan University) gegründet. Zusätzlich waren Anke Gelblin, Tamas Demeny, S.-H. Hsieh, A.R. Srinivasan und Bohdan Schneider Mitglieder des ursprünglichen NDB-Projektteams. Das NDB-Projekt wird durch die National Science Foundation der U.S.A. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://ndbserver.rutgers.edu/
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