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Proteine
Proteine
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Die Database of Immunoglobulins and Integrated Tools (DIG IT) ist eine Onlinequelle, die Informationen über die Sequenzen von immunoglobulinären, variablen Domänen der NCBI-Datenbank enthält. Sie beinhaltet Sequenzen von 145.759 schweren Ketten und 71.404 leichten Ketten (47.168 Kappa-Typ und 24.236 Lambda-Typ), zusammen mit zugeteilten kanonischen Strukturen für die hypervariablen Schleifen und Daten für die Art des Antigen sowie Paarinformationen der immunoglobulinären schweren und leichten Kette ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://www.biocomputing.it/digit4/
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Die Datenbank der Protein-Funktionsstörungen (DisProt) ist eine kuratierte Datenbank, die Informationen über Proteine, die komplett oder teilweise keine feste 3D-Struktur in ihrer mutmaßlich nativen Form besitzen, bereitstellt. DisProt ist eine gemeinschaftliche Bemühung zwischen dem "Center for Computational Biology and Bioinformatics" der Indiana University School of Medicine und dem "Center for Information Science and Technology" an der Temple Universität. [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://www.disprot.org/
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DOLOP provides information for several hundred lipoproteins with relevant links to molecular details. Features include functional classification, predictive algorithm for query sequences, primary sequence analysis and lists of predicted lipoproteins ...
Fakten-Datenbanken
http://www.mrc-lmb.cam.ac.uk/genomes/dolop/
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DOMMINO ist eine umfassende Strukturdatenbank für molekulare Interaktionen. [...] Zusätzlich zu Domäne-Domäne- und Domäne-Peptid-Interaktionen charakterisiert die Datenbank die Interaktion zwischen Domänen und unstrukturierten Proteinregionen, die nicht Teil einer Domäne sind, wie zum Beispiel Linker, N- und C-Termini. Die Interaktionen, die letztere unstrukturierte Bereiche von Proteinen beinhalten, werden in dieser Datenbank zum ersten Mal zusätzlich bereitgestellt, ca. 186.000 Interaktionen (ca. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Fakten-Datenbanken
http://www.dommino.org/
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Dieser Server widmet sich der Analyse von Protein- und Nukleinsäuresequenzen, die zur Superfamilie der alpha-/beta-Hydrolasen gehören, die homolog zu den Cholinesterasen sind. Keine andere Datenbank hält alle alpha/beta Hydrolase-Faltungsproteine zusammen: Interpro, Prosite und Pfam haben einige Einträge für Untermengen dieser strukturellen Superfamilie. Eine Tabelle „Synthese” zeigt die Korespondenz zwischen diesen Datenbankeinträgen und den Superfamilien in ESTHER. Die ESTHER-Tabelle ist momentan ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://bioweb.ensam.inra.fr/ESTHER/general?what=index
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Der ExPASy (Expert Protein Analysis System) Proteomics Server des Schweizerischen Instituts für Bioinformatik (SIB) widmet sich der Analyse von Protein-Sequenzen und -Strukturen sowie 2-D PAGE. [Information des Anbieters, übersetzt]
Fachportale und Linksammlungen
http://www.expasy.org/
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27.
Folding@home
Unser Ziel: Die Proteinfaltung, die Proteinaggregation und die damit zusammenhängende Krankheiten zu verstehen. Proteine sind biologische Arbeitspferde – es sind „Nanomaschinen“. Bevor Proteine ihre biochemische Arbeit aufnehmen, bauen sie sich bemerkenswert selbst zusammen oder „falten“ sich. Obwohl der Prozess der Proteinfaltung entscheidend ist und die Grundlage der ganzen Biologie darstellt, ist er für uns noch immer ein Geheimnis. Es ist daher wohl nicht überraschend, dass es schwere Auswirkungen ... [Information des Anbieters, verändert]
Forschungsprojekte; Thematische Websites
http://folding.stanford.edu/
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FUNCRYPTA, das weltweit größte Tardigradenprojekt, wird durch das BMBF im Rahmenprogramm Biotechnologie - Chancen nutzen und gestalten, "QuantPro - Quantitative Analyse zur Beschreibung dynamischer Prozesse in lebenden Systemen" gefördert. Die wissenschaftlichen Zielsetzungen von FUNCRYPTA sind:
(i) die Identifizierung von Genen, Enzymen und deren Metaboliten, die in der Stabilisierung von Zellen beim Eintritt, während und nach der anhydrobiotischen Phase bei Tardigraden eine Rolle spielen;
(ii) ... [Information des Anbieters]
Forschungsprojekte; Thematische Websites
http://www.funcrypta.de/
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HIstome ist eine frei zugängliche spezialisierte Online-Datenbank zu menschlichen Histon-Varianten und damit zusammenhängenen Themen (einschließlich Enzyme, die Veränderungen bei Histonen bewirken können). Die Datenbank umfasst fünf Typen von Histonen, acht Typen von Modifikationen bei Histonen und 13 Klassen von Enzymen, die Veränderungen bei Histonen bewirken. [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Fakten-Datenbanken
http://www.histome.net/
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"Hot Spots sind energetisch wichtige Seitenketten auf Proteinkontaktstellen und sind nicht zufällig über die Berührungsfläche verstreut, sondern ziemlich konzentriert. Diese gebündelten Hot Spots bilden Hot Regions. Hot Regions sind wichtig für die Stabilität von Proteinkomplexen und liefern auch die Spezifität der Bindungsstellen. Wir schlagen eine Datenbank namens HotRegion vor, welche die Hot Region-Informationen der Bindungsflächen durch die Verwendung vorhergesagter Hot Spot-Seitenketten und ... [Sonstige Quelle laut Angabe]
Fakten-Datenbanken
http://prism.ccbb.ku.edu.tr/hotregion
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