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Proteine
Proteine
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MOPED (Model Organism Protein Expression Database) liefert Proteinexpressionsinformationen, beinhaltet Human- und Modellorganismen (Maus, Wurm, Hefe), vergleicht über Bediungungen, Gewebe und Lokalisationen, ermöglicht stöbern, abfragen und filtern, verbindet zu Gen-, Protein- und Pathway-Daten, gestattet Datenvisualisierung, und verwendet standardisierte SPIRE-Analysekanäle. [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
https://www.proteinspire.org/MOPED
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Organs and organelles represent core biological systems in mammals, but the diversity in protein composition remains unclear. Here, we combine subcellular fractionation with exhaustive tandem mass spectrometry-based shotgun sequencing to examine the protein content of four major organellar compartments (cytosol, membranes [microsomes], mitochondria and nuclei) in six organs (brain, heart, kidney, liver, lung and placenta) of the laboratory mouse, Mus musculus. Using rigorous statistical filtering ...
Fakten-Datenbanken
http://tap.med.utoronto.ca/~mts/
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Das SIB und das GeneBio haben ihre Arbeiten und Kompetenz zusammengelegt um Ihnen neXtProt zugänglich zu machen, welches entwickelt wurde um Forschern zu helfen zu verstehen was all diese Proteine im menschlichen Körper machen. neXtProt ist beides, eine neue und eine alte Ressource: neu, weil wir eine innovative, integrative Ressource über menschliche Proteine entwickeln wollen, und alt, weil wir diese auf der Basis der hoch-qualitativen Arbeiten, die das Markenzeichen von UniProtKB/Swiss-Prot seit ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Fakten-Datenbanken
http://www.nextprot.org/
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44.
NRG-CING
NRG-CING wurde unter Benutzung eines Codes in CING gestaltet. Die NRG-CING-Webseite ist eine Sammlung von CING-Reports, die für alle PDB-Dateien, die im NMR gelöst wurden, vorkalkuliert wurden. Wenn die grundlegenden experimentellen Daten verfügbar sind, wurden diese bereinigt, syntaktisch und semantisch korrigiert und homogen gemacht. Dieser Webserver wird als "NRG-CING integrated validation reports of remediated experimental biomolecular NMR data and coordinates" (NRG-CING integrierte Validationsreporte ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://nmr.cmbi.ru.nl/NRG-CING/HTML/index.html
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Diese Seite enthält alle Daten unserer laufenden proteomischen Analysen des menschlichen Zellkerns, welche als eine Zusammenarbeit zwischen den Lamond- und Mann-Laboren (in Dänemark und in München) erfolgt. Durch Nutzung von hoch sensitiver Massen Spektroskopie und stringenten Kriterien haben wir bis jetzt ca. 700 menschliche, nukleare Proteine identifiziert. Kürzlich haben wir eine quantitative proteomische Annäherung für die zeitliche Charakterisierung des Proteinflusses durch den Kern genutzt, ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://www.lamondlab.com/NOPdb/
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Protein-Lokalisierung in membranumschlossenen Organellen ist ein Schlüsselmerkmal zellulärer Organisation. Mithilfe des Protein Correlation Profiling haben wir 1.405 Proteine in zehn subzellulären Kompartimenten in Leberzellen der Maus kartiert; diese Ergebnisse korrespondieren mit enzymatischen Assays, Marker protein-Profilen und konfokaler Mikroskopie. Diese Lokalisierungen erlaubten die Einschätzung der Spezifität von publizierten Bestandsaufnahmen von Organell-Proteomen, und sie zeigten für 39% ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://141.61.102.16/ormd.htm
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Organelle DB compiles protein localization data from organisms spanning the eukaryotic kingdom and presents an organized catalog of the known protein constituents of more than 50 organelles, subcellular structures, and protein complexes. The data sets in Organelle DB encompass 138 organisms with emphasis on the major model systems: S. cerevisiae, A. thaliana, D. melanogaster, C. elegans, M. musculus, and human proteins as well. In particular, Organelle DB is a central repository of yeast protein ...
Fakten-Datenbanken
http://organelledb.lsi.umich.edu/
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48.
p53 Database
Das Tumorsuppressorprotein p53 war zunächst als essentiell wichtiger Transkriptionsfaktor nach DNA-Schädigungen erkannt worden. In der Folgezeit wurde klar, dass p53 weitreichendere Funktionen im Zusammenhang mit zellulärem Streß besitzt, etwa bezüglich Onkogen-Aktivierung oder Hypoxie. Das Protein p53 fungiert als tetramerer Transkriptionsfaktor, der in normalen nicht gestressten Zellen in sehr niedrigen Konzentrationen vorkommt. Nach Streß können verschiedene Pfade zu posttranslationalen Modifikationen ... [Information des Anbieters, verändert]
Fakten-Datenbanken
http://p53.free.fr/
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Die Protein-Datenbank Japans PDBj (Protein Data Bank Japan) unterhält ein zentralisiertes Proteindatenbank-Archiv von makromolekularen Strukturen und bietet in Zusammenarbeit mit dem RCSB, dem BMRB in den USA und der PDBe der EU integrierte Tools. PDBj wird durch JST-NBDC und die Universität von Osaka unterstützt. [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken; Thematische Websites
http://pdbj.org/
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PenBase provides comprehensive information about penaeidin properties, function, diversity and nomenclature. PenBase contains a Database section that lists all known penaeidins by subgroup or shrimp species. (...) Antimicrobial peptides are major components of innate immunity that have been conserved in evolution and found in different phyla of the plant and animal kingdom. Antimicrobial peptides are often small cationic molecules widely distributed in the whole living kingdom where they participate ...
Fakten-Datenbanken
http://www.penbase.immunaqua.com/
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