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Proteine
Proteine
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Die Datenbank charakterisierter Proteine, CharProtDB, wurde angelegt und entwickelt als von Experten gepflegte Quelle über experimentell charakterisierte Proteine, welche in der veröffentlichten Literatur beschrieben wurden. Für jeden Proteineintrag in CharProtDB wird die Archivierung verschiedener Datentypen unterstützt. Dies beinhaltet funktionelle Anmerkungen (verschiedene Beispiele für Proteinnamen und Gensymbole), taxonomische Klassifizierung, Literaturverknüpfungen, spezifische Genontologiebegriffe ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://www.jcvi.org/charprotdb/index.cgi/home
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The objective of the Ciliary proteome database is to assemble all existing ciliary and basal body proteomics data into an open resource for the scientific community with the ultimate aim of exploring further the role of the cilium in disease and the mechanisms underlying ciliary biology. We have integrated the recent results of several unique, yet overlapping proteomics investigations involving mass spectroscopy, comparative genomics, transcriptional profiling and promoter analyses to decipher the ...
Fakten-Datenbanken
http://www.ciliaproteome.org/
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CATH is a hierarchical classification of protein domain structures, which clusters proteins at four major levels, Class(C), Architecture(A), Topology(T) and Homologous superfamily (H).Class, derived from secondary structure content, is assigned for more than 90% of protein structures automatically. Architecture, which describes the gross orientation of secondary structures, independent of connectivities, is currently assigned manually. The topology level clusters structures into fold groups according ... [Information des Anbieters]
Fakten-Datenbanken
http://www.cathdb.info/cgi-bin/search.pl?search_text=
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COPE ist die aktualisierte und überarbeitete Version des „Dictionary of Cytokines“, der in gedruckter Form 1995 erschien. Dieses Buch war bereits eine überarbeitete Version des deutschen "Lexikon Zytokine", veröffentlicht 1992. Beide Bücher wurden durchaus positiv angenommen, werden jedoch nicht mehr gedruckt.
[Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Fachwörterbücher und Fachlexika
http://www.copewithcytokines.de
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Es gibt zwei Arten von Acetylierungsprozessen, die in den meisten Proteinsequenzen auftreten. Die erste Nα-terminale Acetylierung wird durch eine Vielzahl von N-terminalen Acetyltransferasen (NATs) bewirkt, die die co-translationale Übertragung der Acetylgruppe des Acetyl-CoA auf die α-Aminogruppe der Proteinkette katalysieren. Auch wenn die Nα-terminale Acetylierung in Prokaryoten selten ist, wird geschätzt, dass ca. 85% der eukaryotischen Proteine Nα-terminal modifiziert werden. Der zweite Typ ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Fakten-Datenbanken
http://cpla.biocuckoo.org/
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Cube-DB ist eine Datenbank von vorher ausgewählten Konservierungs- und Spezifikationsbewertungen für Seitenketten in paralogen Proteinen, welche zu mehrfach unterteilten Familien von menschlichen Proteinen gehören. Die Proteinfamilienklassifikation folgt häufig der Klassifikation, welche vom HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC) vorgeschlagen wurde. Sätze von orthologen Proteinsequenzen werden durch wechselseitig am besten passende Strategien erzeugt, die das gesamte, in Ensembl erhältliche Säugetiergenom ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://epsf.bmad.bii.a-star.edu.sg/cube/db/html/home.html
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17.
Dali Database
Der Dali Server ist ein Netzwerk-Service zum Vergleich von 3D-Protein-Strukturen. Man fügt die Koordinaten der gesuchten Proteinstruktur ein und Dali vergleicht sie mit denen der Proteindatenbank. Ein Mehrfaches Überlagern von strukturellen Nachbarn wird dann per E-Mail zugeschickt. Im günstigsten Fall wird der Vergleich von 3D-Strukturen biologisch interessante Ähnlichkeiten enthüllen, die nicht durch den Vergleich von Sequenzen detektierbar sind. Wenn man die strukturellen Nachbarn eines schon ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://ekhidna.biocenter.helsinki.fi/dali/start
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Die Webseite der Datenbank für vergleichbare ribosomale Komplexe (DARC – Database für Aligned Ribosomal Complexes) ist ein Hilfsmittel für den direkten Vergleich der Strukturen von verfügbaren ribosomalen Komplexen.
Die Webseite bietet eine Sammlung von Dateien, die in der RCSB Proteindatenbank und der Electron Microscopy Datenbank hinterlegt sind, und die abgeglichen wurden, sodass ein direkter Vergleich der Strukturen möglich ist.
[Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://darcsite.genzentrum.lmu.de/
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Die Death-Domain(DD)-Superfamilie ist eine der größten Klassen von Proteininteraktionsmodulen, und spielt eine zentrale Rolle bei der Apoptose, bei Entzündungen, bei der Nekrose und dem Immunzellsignalweg. Kritische Caspase-aktivierende Komplexe der Apoptose und dem Entzündungssignalweg werden durch die DD-Superfamilie zusammengebracht. Diese Domänen spielen bei der Rekrutierung von Downstream-Effektoren für Immunzellrezeptorsignaling, der interzellulären Pathogenerkennung und der Antwort auf DNA-Schäden ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Fakten-Datenbanken
http://deathdomain.org/
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Proteomik ist eine sehr junge Forschungsrichtung mit einer sehr viel älteren Wurzel: der Proteinanalytik. Diese befaßt sich mit der Aufklärung von molekularen Eigenschaften wie Aminosäuresequenz, dreidimensionale Struktur und biologische Aktivität individueller Proteine. Untersuchungsgegenstand der Proteomik ist demgegenüber die Gesamtheit aller Proteine in einer biologischen Probe im Moment der Untersuchung und bei den dafür gültigen Bedingungen. Dafür wurde vor etwa 7 Jahren der Begriff "Proteom" ... [Information des Anbieters]
Fachgesellschaften, Berufsverbände, Arbeitsgemeinschaften; Thematische Websites
http://www.dgpf.org/
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