The MicrobesOnline genome database contains over 300 prokaryotic genomes. All genomes are automatically analyzed through the VIMSS genome pipeline. We use publicly available sequence analysis tools and databases to search for homologs (NCBI BLAST, SwissProt, COG) and protein domains (InterPro), to assign gene ontologies (Gene Ontology Consortium) and EC numbers and to map the metabolic pathways (KEGG). We then link the orthology relationships between genes, predict operon structures and regulon networks. Most of the genomes are downloaded from NCBI and genes are parsed from GenBank files. When an incomplete genome is directly downloaded from a sequencing center, we predict protein coding genes using CRITICA and Glimmer, tRNA genes using tRNAscan and other RNA genes by BLASTn. All of the info in the VIMSS genome database is freely available on our website. ... [Information of the supplier]
Das „Fungal Genetics Stock Center“ ist eine Wissensquelle, die der Pilzgenetik-Forschergemeinde und Ausbildungs – und Forschungsorganisationen allgemein zur Verfügung steht. Die FGSC wurde 1960 am Dartmouth College auf Empfehlung der Genetics Society of America gegründet. In diesem Jahr existierten ungefähr 400 Stämme bei der FGSC. Mittlerweile gibt es über 8000 Neurospora-Stämme, eine wachsende Anzahl von Neurospora Knock-out Mutanten, über 2000 Aspergillus-Stämme und verschiedene Vertreter anderer Pilze. Zusätzlich wurden bei der FGSC Gene kloniert und Genbibliotheken erstellt. Anfang 2001 fügten wir Stämme von Magnaporthe grissea samt der molekularen Werkzeuge, um damit arbeiten zu können, hinzu. 2003 und 2004 schließlich existieren nahezu 50000 Magnaporthe Knock-out Mutanten. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Aspergillus flavus ist ein pathogener Pilz, der Pflanzen, Tiere und Menschen befallen kann und das Carcinogen Aflatoxin produziert. Ein multidisziplinär aufgestelltes Forscherteam koordiniert nun seine Forschungsanstrengungen, um diesen Pilz und die mit ihm einhergehende Produktion des Toxins in Lebensmittelen und Tierfutter zu verhindern. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Mit dem Projekt "Ökologische Pilzkartierung 2000" hat die Deutsche Gesellschaft für Mykologie eine neue Ära der Bestandserfassung von Großpilzen eingeläutet. Die bisherige chorologische Kartierung, deren Erbgebnisse mit 4 Millionen Fundpunkten vom ehemaligen Vorsitzenden der DGfM, German Krieglsteiner, in 18jähriger mühevoller Kleinarbeit in Form der 2 Bände des "Verbreitungsatlas der Großpilze Deutschlands" verewigt wurden, wird von dem neuen Projekt keineswegs abgelöst. Vielmehr ist die "Kartierung 2000" als Erweiterung der rein chorologischen Kartierung zu verstehen. Die Computerunterstützung mit dem PC-Programm "Ökologische Pilzkartierung 2000" macht es möglich, Funddaten rasch auszuwerten und zu verwalten. So erwartet die DGfM bei gleicher Aktivität der Mitarbeiter eine Verfünfzehnfachung der Datenmenge. [Deutsche Gesellschaft für Mykologie] ... [Sonstige Quelle laut Angabe]
Microorganisms are a key component of the Earth’s biosphere, and microbial communication – whether between microbes, with higher organisms or with the environment – is an important driver of the Earth system. Our annual International Conference on Microbial Communication (MiCom) for students aims to generate new understanding of these interactions and their many consequences from molecular to global scales. MiCom is organized and hosted each year by PhD students from the Jena School for Microbial Communication (JSMC). We cordially invite you to join us for our 3rd year of discussion and interdisciplinary collaboration with a growing international community of young scientists. Both talks and poster presentations are welcome. We hope to see you there! ... [Information of the supplier]
Die Website "ProGlycProt" (Prokaryotische Glykoproteine) ist ein manuell gepflegter, umfassender Speicherort für experimentell charakterisierte bakterielle und archaeelle Glykoproteine, welcher mittels einer gründlichen Literatursuche generiert wird. Dies ist der Anfang der Bemühungen prägnante, relevante Informationen in einer vergleichenden Methode zu liefern, welche sich von der rasch anwachsenden Literatur über prokaryotische Glykoproteine, ihre glykosylierenden Enzyme, an Glykosylation gekoppelte Gene und deren genomischen Kontext ableiten lassen. ProGlycProt ist eine umfangreiche Online-Sammlung experimentell verifizierter Glykosites und Glykoproteinen von Prokaryoten. Zum Vorteil der Nutzer ist die Datenbank unter dem Menüpunkt ProGlycProtdb in zwei Sektionen unterteilt, ProCGP und ProUGP. ProCGP ist der Hauptabschnitt, welcher aus charakterisierten prokaryotischen Glykoproteinen besteht, definiert als Eintragungen mit mindestens einem experimentell bestätigten "glykosylierten Rest". ProUGP dahingegen ist die ergänzende Sektion, welche uncharakterisierte prokaryotische Glykoproteine präsentiert, definiert als Eintragungen mit experimentell identifizierter Glykosylation aber undefinierten Glykosites. ProGlycProt wurde mit dem Ziel entwickelt als Hilfsmittel zu fungieren aber auch das aufkommende wissenschaftliche Interesse am Verständnis von Mechanismen, Auswirkungen und Neuheiten der Protein-Glykosylation in Prokaryoten zu steigern, was viele krankheitserregende und auch ökonomisch wichtige bakterielle Arten einschließt. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
We neither see nor hear them in our everyday life, but the inhabitants of the microbial world are constantly in communication. This invisible world houses various types of diverse interactions. MiCom aims to provide a platform to present and share knowledge about the latest research on a variety of themes encompassing microbial interactions. The conference focuses on both symbiotic and pathogenic microbial together with their natural habitat and the molecules involved in the interactions as well as the recent tools used in such research. The Jena School of Microbial Communication and the MiCom 2014 Organising Team would be pleased to welcome you in 2014 to discuss the latest news from the microbial world. ... [Information of the supplier]