Diese Seite erlaubt den Vergleich einer Antikörper-Sequenz mit der Kabat-Datenbank. Alle ungewöhnlichen Aminosäuren, die in weniger als 1% der Sequenzen in der Datenbank vorkommen, werden dem Benutzer angezeigt; dadurch können Klonierungsartefakte und Sequenzierfehler erkannt werden. Die Kabat-Datenbank umfaßt im Moment (März 2007) 6014 leichte Ketten und 7895 schwere Ketten. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Der Allen Brain Atlas (ABA) stellt eine interaktive und genomweite Bilddatenbank der Genexpressionsmuster im Mäusegehirn dar. Auf der Webseite sind eine Kombination von RNA In-Situ Hybridisierungsdaten, ein ausführlicher Referenzatlas und ein IT-gestütztes Analysewerkzeug integriert worden, um einen durchsuchbaren, digitalen Atlas der Genexpression bereitzustellen. Zusammengenommen bieten diese Resourcen Ihnen eine umfangreiche Online-Platform für die Erforschung des Gehirns auf zellulärer und molekularer Ebene. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
In der ArrayExpress Datenbank sind Experimente im Bereich der funtionellen Genomik einschließlich Genexpressionsexperimenten enthalten. Die dem MIAME- und MINSEQE-Standard entsprechenden Einträge können durchsucht und heruntergeladen werden. Der Gene Expression Atlas beinhaltet Experimente, die unter individuell veränderten Bedingungen und entsprechenden Anpassungen durchgeführt wurden. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Bgee ist eine Datenbank für das Abrufen und den Vergleich der Genexpressionsmuster zwischen Tierarten. Bgee bildet zuerst heterogene Expressionsdaten zur Anatomie und Entwicklung von verschiedenen Arten ab (aktuell Expressed Sequence Tags (EST), Affymetrix und in-situ-Hybridisierungsdaten). Anschließend wurden Homologiebeziehungen zwischen Anatomien, und Vergleichskriterien zwischen Entwicklungsstadien entwickelt, um automatisierte Vergleiche über die Artgrenzen hinaus durchführen zu können. Auf die Daten kann durch Ontologie-Browsing, Textsuche, Expressionssuche oder erweiterte Expressionssuche zugegriffen werden. Genexpressionsmuster können durch das Auswählen einer beliebigen Genfamilie (z.B. ENSFM00500000270089) verglichen werden. Die gesamten Inhalte der Bgee Expressionsdatenbank, der Ontologien, der Homologieverknüpfungen zwischen anatomischen Ontologien und die Beziehungen zwischen Entwicklungsontologien sind alle im Download-Bereich erhältlich. Weitere Information ist in der Dokumentation bereitgestellt. Alle Datenquellen, die in Bgee benutzt wurden, sind auf der Datenquellen-Seite aufgelistet. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
caArray ist ein Open-Source Array-Datenmanagement-System, welches als Programm verfügbar und zudem über das Internet zugänglich ist. caArray fördert die Kommentierung und den Austausch von Array-Daten durch die Verwendung eines föderativen Models von lokalen Installationen, dessen Ergebnisse innerhalb von caBIG (cancer Biomedical Informatics Grid) geteilt werden können. Das Datenmanagementsystem fördert die translationale Krebsforschung durch Erfassung, Verbreitung und Vereinigung von semantisch dialogfähigen Array-Daten um anschließende Analysen durch Tools und Services zu unterstützen. Sobald die Array-Technologie sich weiterentwickelt hat und ausgereift ist, wird caArray seine Bibliothek zu Assay-Management erweitern. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Codon Usage Database ist eine erweiterte WWW-Version von CUTG (Codon Usage Tabulated from GenBank). Die Datenbank ermöglicht Recherchen zur Häufigkeit von Codonen in verschiedenen Organismen. Datenbestand (Stand Januar 2007): 32.775 Organismen, 2.298.913 vollständige Protein-kodierende Genes (CDS's). Benutzung: Eine Suchmaske erlaubt die Abfrage von Tabellen zur Codon-Häufigkeit für Organismen; für die Suche können wissenschaftliche Namen oder Teile davon verwendet werden. ... [Information des Anbieters]
Cyanobacteria carry a complete set of genes for oxygenic photosynthesis, which is the most fundamental life process on the earth. This organism is also interesting from an evolutional viewpoint, for it was born in a very ancient age and has survived in various environments. Chloroplast is believed to have evolved from cyanobacterial ancestors which developed an endosymbiontic relationship with a eukaryotic host cell. CyanoBase provides an easy way of accessing the sequences and all-inclusive annotation data on the structures of the cyanobacterial genomes. ... [Information of the supplier]
Willkommen bei DAVID Bioinformatics Resources 2003-2009, der Datenbank für Annotation, Visualiserung und integrierte Erforschung von Genen. DAVID 2008 ist die sechste Version des ursprünglichen per Web zugänglichen Programms. DAVID bietet nun eine reichhaltige Reihe von funktionellen Programmen für Forscher, um die biologische Bedeutung hinter langen Codereihen von Genen verstehen zu können. Die DAVID Programme können mit jeder eingegebenen Liste folgende Funktionen erfüllen: wichtige biologische Themen identifizieren; Funktionelle Beziehungen zwischen Gen-Gruppen aufspüren; Nach verwandten Genen suchen; Wechselwirkende Proteine aufzählen; und Verknüpfungen zwischen Genen und Krankheiten herstellen. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Die Dfam Datenbank ist eine Sammlung von repetitiven DNA-Element-Sequenzanordnungen, Hidden-Markov models (HMM) und Listen für komplette eukaryotische Genome. Transposons machen einen wesentlichen Teil der eukaryotischen Genome aus. Die genaue Annotation von TEs ermöglicht die Erforschung ihrer Biologie und kann Aufschluss auf die evolutionären Prozesse, die Genome formen, geben. Dfam stellt eine Sammlung von Anordnungen und HMMs solcher Transposons und anderer repetitiven DNA-Elementen zur Verfügung. Die DFAM Website enthält Informationen über jedes Modell und bietet Genomannotationen für eine Sammlung von Kern Genomenn. Die Modelle können auch von der FTP-Site heruntergeladen werden, zum Beispiel, um Wiederholungen in neuen Genomen zu maskieren. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Die Anfänge der DDBJ (DNA Data Bank of Japan) am National Institute of Genetics (NIG) reichen bis in das Jahr 1986 zurück. Seit Beginn fungiert DDBJ als eine der Internationalen DNA-Datenbanken, zu denen auch EBI in Europa und NCBI in den USA als die beiden anderen Mitglieder gehören. Folglich arbeiten wir mit diesen Datenbanken durch Austausch von Daten und Informationen sowie durch regelmäßig stattfindende Konferenzen zusammen. DDBJ ist die einzige DNA-Datenbank in Japan, die offiziell zum Sammeln von DNA-Sequenzen aus der Forschung und zum Ausgeben der international akzeptierten Accession Numbers zertifiziert ist. Wir sammeln primär Daten von japanischen Forschern, integrieren aber natürlich auch Daten von Forschern aus beliebigen anderen Ländern. Da wir die gesammelten Daten täglich mit EMBL/EBI und GenBank/NCBI abgleichen, weisen alle drei Datenbanken praktisch zu jeder Zeit denselben Datenbestand auf. Wir bieten weiterhin zahlreiche Tools für Recherche und Datenanalyse, die durch DDBJ und andere entwickelt worden sind. ... [Information des Anbieters, übersetzt]