Das European Bioinformatics Institute (EBI) bietet Zugang zu verschiedenen Typen biologischer Datenbanken. Auf dieser Webseite finden Sie eine kurze Zusammenfassung der Typen verfügbarer Datenbanken (mit Links) sowie Tools, mit denen verschiedenartige biologische Daten abgefragt werden können. [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
eQuilibrator ist ein einfaches Web-Interface, welches einfache thermodynamische Analysen von biochemischen Systemen ermöglichen soll. eQuilibrator erlaubt eine freie Textsuche für biochemische Stoffe und Reaktionen, und bietet thermodynamische Abschätzungen für beides unter verschiedenen Bedingungen. Abschätzungen von thermodynamischen Parametern (ΔrG und ΔfG) klären auf, wie viel Energie nötig ist, um eine bestimmte biochemische Reaktion voranzutreiben, und in welche Richtung diese Reaktion unter bestimmten zellulären Bedingungen ablaufen wird. Da experimentelle Messungen der freien Bildungsenergie (ΔfG°) von Stoffen technisch aufwendig sind, wurden die meisten bekannten Metabolite nicht thermodynamisch charakterisiert. eQuilibrator benutzt gut untersuchte Approximationen von ΔfG, im Speziellen der Gruppenbeitragsmethoden (Fragmentmethoden), welche es ermöglichen thermodynamische Analysen an vielen biochemischen Reaktionen und Reaktionswegen (Biochemical Pathways) durchzuführen. Momentan bietet eQuilibrator Abschätzungen für viele Stoffe aus der KEGG–Datenbank (ca. 4500). Einzelne Stoffe und Enzyme können mittels ihrer gebräuchlichen Namen (Wasser, Glucosamin, Hexokinase) gesucht werden, und Reaktionen können in einem einfachen, freien Textformat (Ribulosebisphosphat + CO2 + Wasser -> 2-3-Bisphosphoglycerat) eingegeben werden, eQuilibrator analysiert diese automatisch. eQuilibrator erlaubt es außerdem Manipulationen an den Bedingungen, wie dem pH, der Ionenstärke, sowie Reaktanden- und Produktkonzentrationen, einer Reaktion vorzunehmen um Ihnen bei der Erkundung der thermodynamischen Landschaft von biochemischen Reaktionen zu helfen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Die Gesellschaft für Biochemie und Molekularbiologie ist mit ca. 5.500 Mitgliedern die größte biowissenschaftliche Fachgesellschaft Deutschlands. Ziel der GBM ist die Förderung von Forschung und Lehre der Biochemie und molekularen Biologie. Die GBM fördert außerdem die Umsetzung wissenschaftlicher Erkenntnisse auf dem Gebiet der Biotechnologie und Medizin und deren Verbreitung in der Öffentlichkeit. Ihr Tätigkeitsfeld umfaßt alle Disziplinen, die der Erklärung biologischer Vorgänge auf molekularer Ebene dienen, insbesondere die Biochemie, Biophysik, Molekulargenetik, molekulare Zellbiologie, molekulare Entwicklungsbiologie, molekulare Mikrobiologie, Pflanzenbiochemie, Bioinformatik, Strukturbiologie, molekulare Neurobiologie und molekulare Medizin sowie die Entwicklung neuer Gebiete der molekularen Biowissenschaften. ... [Information des Anbieters]
GoPubMed ist eine ontologiebasierte Suchmaschine, die eine Recherche nach biomedizinischen Publikationen in PubMed erlaubt. "Die Gene Ontology wird als 'Inhaltsverzeichnis' benutzt, um die ca. 16 Millionen Artikel der Datenbank MEDLINE (Stand 2006) zu strukturieren. Die Suchmaschine erlaubt Biologen (und Medizinern) wesentlich schneller, relevante Suchresultate zu finden. Die in GoPubMed verwendete Technologie ist generisch und kann prinzipiell für beliebige Texte und beliebige Wissensbasen (Ontologien) eingesetzt werden. GoPubMed ist eine der ersten Web 2.0 Suchmaschinen. Sie wurde von einer Arbeitsgruppe um Prof. Dr. Michael Schroeder an der Technischen Universität Dresden und Transinsight, einem spin-off der TU, entwickelt" (Aus: Artikel GoPubMed. In: Wikipedia, Die freie Enzyklopädie. Bearbeitungsstand: 2. März 2007, 19:04 UTC. URL: http://de.wikipedia.org/w/index.php?title=GoPubMed&oldid=28578917 [Abgerufen: 9. März 2007, 07:23 UTC]). ... [Sonstige Quelle laut Angabe]
The Jena Library of Biological Macromolecules (JenaLib) is aimed at a better dissemination of information on three-dimensional biopolymer structures with an emphasis on visualization and analysis. It provides access to all structure entries deposited at the Protein Data Bank (PDB) or at the Nucleic Acid Database (NDB). In addition, basic information on the architecture of biopolymer structures is available. The JenaLib intends to fulfill both scientific and educational needs. ... [Information of the supplier]
OpenWetWare ist ein Vorhaben zur Förderung des Austauschs von Informationen, Know-how und Erfahrungen zwischen Forschern und Arbeitsgruppen auf den Gebieten Biologie und Biotechnologie. OWW bietet einen Platz, auf dem Labore, Individuen und Arbeitsgruppen ihr eigenes Wissen organisieren und effizient miteinander austauschen können. Wir hoffen, daß mit dem Fortgang des Vorhabens OWW nicht nur zu einer verbesserten Zusammenarbeit zwischen den Mitgliedern führen wird, sondern auch ein nutzbringendes Informationsportal für unsere Kollegen sowie für den Rest der Welt bieten wird. Wenn Sie schreibenden Zugriff auf OWW wünschen, oder auf andere Weise etwas beitragen wollen., oder wenn Sie die Website Ihres Labors bei OpenWetWare hosten lassen möchten: bitte werden Sie Mitglied. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Das "Biosciences Gateway" der Royal Society of Chemistry (RSC) verlinkt zu allen biowissenschaftlichen Inhalten der Webpräsenz der RSC. [Information des Anbieters, übersetzt]