Das European Nucleotide Archive (ENA) speichert und veröffentlicht Informationen, die mit den experimentellen Arbeitsabläufen der Nukleotidsequenzierung zu tun haben. In der ENA-Datenbank werden alle Informationen, angefangen beim Input (Probe, Protokolle, Konfiguration der Geräte) über den Output des Sequenziergerätes (DNA-Sequenzen und Zusatzinformationen wie die Qualitätswerte) bis hin zu den Interpretationen der Analysen (Zusammenfügung der Sequenzen, Mapping und funktionelle Zuordnungen) hinterlegt. Die Daten erhält das ENA unter anderem von den größten europäischen Sequenzierzentren und durch Austausch mit anderen Partnerdatenbanken der International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC). ENA besteht aus einer Vielzahl von Datenbanken, die die EMBL-Bank, das Sequence Read Archive (SRA) und das Trace Archive beinhalten. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
EMAGE ist eine Datenbank mit Daten von in situ Genxpressionen von Mäuseembryos und bietet zusätzlich Tools zur Suche und Analyse der Daten an. In der Datenbank befinden sich Daten zur mRNA in situ Hybridisierung, Proteinchemie und transgenetische Reporterdaten. Die Daten stammen von verschiedenen Forschungsgruppen der Forschergemeinschaft und werden von den Verwaltern der Datenbank beschrieben und standardisiert, um den Richtlinien zu entsprechen. Die Beschreibungen beinhalten eine textbasierte Komponente, aber der einzigartige Aspekt von EMAGE ist der Fokus auf die dreidimensionalen Erläuterungen. Ziel von EMAGE ist a) einen Bezugspunkt für biomedizinische und klinische Forscher zu schaffen, an dem auf sie die in situ Genexpressionsdaten der Forschungsgemeinschaft zugreifen können, b) eine hochwertige Verwaltung und damit Erläuterung dieser Daten im dreidimensional-zeitlichen und anatomischen Netzwerk des EMAP Digital Atlas anzubieten, c) Methoden für die Analyse dieser Daten zu entwickeln und anzubieten und d) EMAGE im weiten Kontext anderer bioinformatischer Ressourcen anzubieten und ein Tool zum Verständnis der genetischen Kontrolle der Mäuseembryogenese zu entwickeln. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
In der ArrayExpress Datenbank sind Experimente im Bereich der funtionellen Genomik einschließlich Genexpressionsexperimenten enthalten. Die dem MIAME- und MINSEQE-Standard entsprechenden Einträge können durchsucht und heruntergeladen werden. Der Gene Expression Atlas beinhaltet Experimente, die unter individuell veränderten Bedingungen und entsprechenden Anpassungen durchgeführt wurden. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Das Ziel der HOM-Datenbamk ist es, der Forschergemeinschaft verständliche Information zum Thema der ca. 600 Prokaryonten, deren Lebensraum die menschliche Mundhöle ist, zugänglich zu machen. Die Mehrzahl der Arten werden weder in einem Labor kultiviert, noch wurden sie benannt, und sie werden lediglich auf Grund ihrer 16S rRNA-Sequenzen identifiziert. Die HOMD arbeitet mit einem provisorischen Namensgebungsschema, um die bislang unbenannten Arten einheitlich zu identifizieren und Stammkulturen, Klone und Probendaten aus einem beliebigen Labor direkt und unverwechslebar mit einem Namen verbinden zu können. Die HOMD verbindet Sequenzdaten mit phänotypischen, phylogenetischen, klinischen und bibliografischen Informationen. Genomsequenzen von Bakterien, deren Lebensraum vollständig oder auch nur teilweise in der menschlichen Mundhöle liegt, und die folglich auf dem Interessengebiet dieses Forschungsvorhabens und das des Human Microbiome Project liegt, werden nach ihrer Veröffentlichung schnellstmöglich in die HOMD aufgenommen. Die HOMD bietet einfach zu bedienende Werkzeuge, um die Genome der öffentlich zugänglichen Bakterien zu betrachten. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Das Standord Human-Oligogenom-Projekt bietet eine Datenbank von erfassten Capture-Oligonukleotiden für die Durchführung von gezielter Hochdurchsatz-Abschnittsequenzierung des menschlichen Genoms. Dieser Satz an Capture-Oligonukleotiden deckt über 92% des humanen Genoms hg19/build 37 ab, und über 99% der kodierenden Regionen, definiert durch CCDS. Die Capture-Reaktion verwendet einen hoch gebündelten Ansatz für das selektive Zirkularisieren und Abfangen von verschiedenen genomischen Regionen durch die Verwendung der in-solution-Methode, vorgestellt in Natsoulis et al, PLoS One 2011. Kombinierte Pools von Capture-Oligonukleotiden zirkularisieren selektiv das genomische DNA-Target, gefolgt von einer spezifischen PCR-Amplifizierung von Zielregionen mit der Verwendung eines durchgängigen Primerpaares für alle der Capture-Oligonukleotiden. Im Gegensatz zu Multiplex-PCR-Methoden ist die selektive, genomische Zirkularisierung fähig, effizient Hunderte von genomischen Regionen gleichzeitig im Mehrfachbetrieb zu amplifizieren, ohne dass eine umfassende PCR-Optimierung notwendig ist oder ungewünschte Nebenprodukte auftreten. Vorzüge der selektiven Genomzirkularisierungsmethode ist die relative Robustheit dieser Technik und die günstige Synthese von Standard-Capture-Oligonukleotiden zur Auswahl genomischer Regionen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Der Ozean ist das einflussreichste, aber am wenigsten verstandene Ökosystem unseres Planeten – ein komplexes Netz von interagierenden Arten, von denen alles Leben abhängt, Nahrung, Klima und sogar die Luft, die wir atmen. Um diese natürliche Ressource von den Bedrohungen durch globale Erwärmung, Zerstörung der Lebensräume, Überfischung und Verschmutzung zu schützen, benötigen wir ein besseres Verständnis für die Diversität des marinen Lebens. Das Genom ist die Summe aller DNA innerhalb einer lebenden Zelle oder eines Organismus. Es ist der Bauplan, nachdem eine Art geformt ist und eine Aufzeichnung seiner Physiologie, Ökologie, Vergangenheit und Evolution. Solche genomische Information ist nicht nur unschätzbar um die Art vom Aussterben zu schützen, sondern kann auch helfen, Krankheiten zu heilen oder die Nachhaltigkeit der globalen Nahrungs- und Energieversorgung zu verbessern. Das Vermächtnis, das wir unserer zukünftigen Generation hinterlassen, hängt von den Entschlüssen ab, die wir heute machen um die bedrohte Diversität des weltgrößten Ökosystems zu bewahren, zu schützen und zu erforschen. Ocean genome Legacy ist ein gemeinnütziges marines Forschungsinstitut und Genombank, gewidmet der Erforschung und Bewahrung der bedrohten biologischen Diversität der Meere. Der Zweck unsere Sammlung ist die Bereitstellung einer sichere Archivierung und eines umfassenden öffentlichen Zugangs zu genomischen Materialien, um ein Forum für den Austausch von Proben, Daten, Ideen zu schaffen und als Katalysator für die Forschung zu dienen, die hilft, das marine Ökosystem zu schützen und menschliche Bedingungen zu verbessern. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Gene Weaver erlaubt es Anwendern phänotypspezifische Gen-Sets (Gene-Sets) über die Artgrenze hinaus, Gewebe und experimentelle Plattform zu integrieren. Gene-Sets können privat, zwischen Anwendern spezifischer Gruppen von Investoren und zwischen allen Anwendern gespeichert, geteilt und verglichen werden. Daten auf der Webseite sind in Sätzen von Genen oder Gen-Sets organisiert. Diese Sätze enthalten neben den Gen-Sets einige einfache Metadaten, wie Name, Beschreibung und Informationen zur Veröffentlichung. All diese Information kann gesucht werden, um den für Sie interessanten Satz zu finden. Phänotypdatensets können aus vielen verschiedenen Quellen stammen, einschließlich, aber nicht ausschließlich: Microarray-Expressions-Studien, Gene Ontology-Kategorien, Text Mining Tools, konservierten Modulen oder einfach aus einer Liste von Genen, die Sie interessant finden. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
GONUTS ist ein "Gene Ontology Normal Usage Tracking System". Das GONUTS-Wiki wurde eingerichtet, um eine Fremddokumentation für Benutzer von Gene Ontology-Projekten (GO-Projekte) zu ermöglichen. Das GO-Wiki ist kein offizielles Produkt der GO-Vereinigung. Es wurde durch Benutzer der TAMU für Neueinsteiger in GO, welche den Gebrauch von GO erforschen möchten, erstellt. Die Gründe für diese Wiki-Seiten sind in "About GONUTS" erläutert. Um die Ontology-Seiten zu betreten, gehen Sie auf "GO"-Page, oder suchen Sie einen Begriff gezielt. Für mehr Informationen, wie dieses Wiki automatisch upgedated wird, schauen Sie sich die Seite "Go Wiki Scripts" an. Für Hilfe bezüglich der Benutzung des Systems gehen Sie auf "Help": Inhalte, welche in den Navigationslinks von allen Seiten erhältlich sind. Schauen Sie sich die Seite "Current Events" an, um über aktuelle Veränderungen auf der GONUTS-Seite informiert zu werden. Hinterlassen Sie Kommentare und Vorschläge auf unseren "Known Issues"-Seiten. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
In the 50 years since RNA was identified as a central component in the flow of genetic information, it has become increasingly clear that RNA is more than a mere messenger and performs many diverse and interesting functions. This symposium will explore the diverse, dynamic and multifaceted roles of RNA across a spectrum of cellular processes. Yet, framed in interdisciplinary discussion of the roles of non-coding RNAs with the aim of enhancing our understanding of gene regulation and function. Topics will include recent discoveries in the fields of prokaryotic and eukaryotic long and short non-coding RNAs. Collectively aiming to further understand the noncoding RNA transcriptional and regulatory landscape. ... [Information of the supplier, modified]
Zur Weiterentwicklung der personellen Genomik arbeiten Freiwillige aus der Bevölkerung mit Wissenschaftlern zusammen. Wir glauben, Individuen aus der Bevölkerung spielen eine wichtige Rolle dabei, das "persönliche Genom" in der Medizin nutzbar zu machen. Wir suchen Freiwillige, die ihre Genomsequenz und viele verschiedene persönliche Informationen mit der Forschungsgemeinde und der Öffentlichkeit teilen wollen, zur Erweiterung unseres Verständnisses von den genetischen und Umwelteinflüssen auf menschliche Eigenschaften. Lernen Sie mehr darüber, wie Sie mitmachen können. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
