caArray ist ein Open-Source Array-Datenmanagement-System, welches als Programm verfügbar und zudem über das Internet zugänglich ist. caArray fördert die Kommentierung und den Austausch von Array-Daten durch die Verwendung eines föderativen Models von lokalen Installationen, dessen Ergebnisse innerhalb von caBIG (cancer Biomedical Informatics Grid) geteilt werden können. Das Datenmanagementsystem fördert die translationale Krebsforschung durch Erfassung, Verbreitung und Vereinigung von semantisch dialogfähigen Array-Daten um anschließende Analysen durch Tools und Services zu unterstützen. Sobald die Array-Technologie sich weiterentwickelt hat und ausgereift ist, wird caArray seine Bibliothek zu Assay-Management erweitern. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
PomBase ist eine neue Datenbank für einen Modellorganismus; sie bietet für die wissenschaftlichen Daten über die Hefe Schizosaccharomyces pombe eine Ordnungsstruktur und einen Zugang. PomBase unterstützt genomische Sequenzen und Funktionen, Genom-weite Datenbestände und die Pflege manueller Literaturdaten. PomBase liefert außerdem einen Gemeinschafts-Hub für Forscher, Genom-Statistiken, eine Community-Kontaktmöglichkeit, Neuigkeiten, Veranstaltungen, Quellenbenutzung und Mail-Listen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Polbase ist ein offener Speicher von Informationen zum Thema DNA-Polymerase. Ziele sind: a) Lieferung einer freien und offenen Informationsquelle, fokussiert auf DNA-Polymerasen; b) Zusammenstellung von Auszügen der wichtigsten Ergebnisse von veröffentlichten und unveröffentlichten Quellen; c) Präsentation der Ergebnisse im Kontext, aber ohne redaktionelle Befangenheit, bestätigt durch Autoren; d) Schaffung eines Hubs mit DNA-Polymerase als Mittelpunkt, durch Verbindung mit anderen Protein-Ressourcen; e) Berücksichtigung der Ratschläge von der Community; f) Verbleib bei der aktuellen automatischen Identifizierung neu veröffentlichter Paper; g) Nachhaltigkeit! Durch Beteiligung der Polymerase-Forschungs-Community können wir eine nützliche Quelle mit minimalem Aufwand von jedem individuellen Mitarbeiter anfertigen lassen. Die DNA-Polymerase-Datenbank (Poolbase) ist vorgesehen als Zusammenstellung der Fülle von existierenden DNA- Polymerase-Informationen von privaten und öffentlichen Aufzeichnungen in eine offene durchsuchbare Datenbank. Sie ergänzt existierende Quellen, zum Beispiel: a) PubMed; b) ExPASy; c) UniProtKB; d) RCSB PDB; e) KEGG; f) PROSITE; g) BRENDA; h) Human Polymerase Gamma Mutation Database. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Das Ziel des Nukleinsäure-Datenbank-Projekts (NDB) ist es, strukturelle Informationen zu Nukleinsäuren zu sammeln und zu verbreiten. Das NDB wurde im Jahre 1992 durch Helen M. Berman (Rutgers University), Wilma K. Olson (Rutgers University) und David Beveridge (Wesleyan University) gegründet. Zusätzlich waren Anke Gelblin, Tamas Demeny, S.-H. Hsieh, A.R. Srinivasan und Bohdan Schneider Mitglieder des ursprünglichen NDB-Projektteams. Das NDB-Projekt wird durch die National Science Foundation der U.S.A. und das Department of Energy finanziert. Das NDB führt die mmCIF Website. mmCIF (macromolecular Crystallographic Information File) ist die IUCr-geprüfte Datenrepräsentation für makromolekulare Strukturen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
L1Base ist eine Datenbank, die sich mutmaßlich aktiven LINE 1-Elementen verschrieben hat, welche in Human- und Nagergenomen angesiedelt sind: a) Interaktion in zwei ORFs, full length L1s (FLI-L1s) und b) L1s mit Interaktion an ORF2, aber zerstörten ORF1 (ORF2-L1s). Zusätzlich sind aufgrund ihres regulatorischen Potentials auch die Full length (>6000bp)-nichtinteragierenden L1s (FLI-L1s) in der Datenbank enthalten. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
“Multi-purpose Automated Genome Project Investigation Environment” (MAGPIE, http://magpie.ucalgary.ca/) ist ein Softwarepacket für die automatisierte Verwaltung und Präsentation von DNA- und Proteinsequenzen. MAGPIE filtert die Ergebnisse verschiedener Datenbanksuchergebnisse auf jede Sequenz (z.B. exprimierte Sequenz-Taqs, ESTs) oder Untersequenzen (z.B. offenes Leseraster, ORFs, in bakterieller genomischer DNA), und zeigt sie auf einer Zusammenfassungsseite, die Interpretationen der biologischen Rolle von Genen und Origins ermöglicht, an. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
We are happy to announce that 2013 is the 10 year anniversary of DNA barcoding and we plan to celebrate this milestone in Kunming, China. The Chinese Academy of Sciences’ and Kunming Institute of Botany are pleased to be hosting this year’s conference. The conference will consist of four days of plenary and parallel sessions. Preconference events, such as discussion meetings focusing on advances in sequencing and informatics techniques will be held on the Sunday before the conference. There is also a Training Course associated with the conference (max 30 delegates). Past conferences have brought together participants from over 60 countries, including researchers, students, government officials, and representatives of NGOs and private companies. This year’s conference hosts, the Chinese Academy of Science and Kunming Institute of Botany, have provided a venue that hosts up to 500 participants. ... [Information of the supplier]
The Institute of Cytology and Genetics, Novosibirsk, Russia, will arrange the 9th International Conference on the Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2014). These regular conferences have been run since 1998. The young scientists' school “Bioinformatics and Systems Biology” will be arranged as part of the conference. Bioinformatics is a rapidly developing field of knowledge. Each of the past BGRS conferences concerned topics urgent at those times. To preserve this tradition, the BGRS-2014 conference will be dedicated to bioinformatics and systems biology. ... [Information of the supplier]
Die Dfam Datenbank ist eine Sammlung von repetitiven DNA-Element-Sequenzanordnungen, Hidden-Markov models (HMM) und Listen für komplette eukaryotische Genome. Transposons machen einen wesentlichen Teil der eukaryotischen Genome aus. Die genaue Annotation von TEs ermöglicht die Erforschung ihrer Biologie und kann Aufschluss auf die evolutionären Prozesse, die Genome formen, geben. Dfam stellt eine Sammlung von Anordnungen und HMMs solcher Transposons und anderer repetitiven DNA-Elementen zur Verfügung. Die DFAM Website enthält Informationen über jedes Modell und bietet Genomannotationen für eine Sammlung von Kern Genomenn. Die Modelle können auch von der FTP-Site heruntergeladen werden, zum Beispiel, um Wiederholungen in neuen Genomen zu maskieren. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
HEXEvent ist eine freie Datenbank, die eine Liste der menschlichen internen Exons bereitstellt und über alle bekannten Spleiß-Ereignisse berichtet, basierend auf EST-Informationen aus dem UCSC Genome Browser. Diese Liste kann durch den Benutzer entweder auf nur eine spezifische Region im Genom (durch Angabe des Chromosoms, des Strangs und der Start- und Endposition), auf ein ganzes Chromosom oder eine Gruppe von Genen begrenzt werden. Weiterhin können Exons nach ihrem Spleiß-Typ (konstitutive Exons, Kassetten-Exons und Exons mit einer oder mehreren alternativen 3'-und / oder 5'-Spleißstellen) gefiltert werden. Um eine benutzerdefinierte Gruppe von Exons zu extrahieren, können die Benutzer spezifische Definitionen von Exon-Arten festlegen. Der Benutzer muss angeben in welcher Fraktion von ESTs ein Exon sein darf, um alternativ gespleißt und noch als konstitutiv bezeichnet zu werden. Darüber hinaus kann der Benutzer die Menge der angeforderten Kassetten- Exons durch ein bestimmtes oberes Level beschränken. ... [Information des Anbieters, übersetzt]