Menschen empfinden zahlreiche chemische Verbindungen als bitter. Die Bitterheit eines Stoffes weist oft auf seine mögliche Giftigkeit und die Abneigung gegen Bitteres hilft, Giftiges nicht zu sich zu nehmen. Ein gut bekanntes Beispiel ist Strychnin. Einige andere bittere Stoffe, wie Koffein, sind genießbar und werden in großen Mengen konsumiert, während sie in hohen Dosen giftig sind. Die Zahl der bitteren Moleküle wird in die Tausende geschätzt. Aber was sind diese Verbindungen? Wie ähnlich oder verschieden sind ihre chemischen Eigenschaften? Agieren sie an den selben oder unterschiedlichen Rezeptoren? Ist es möglich, die Bitterheit eines Moleküls vorherzusagen? Um die Erforschung dieser verblüffenden Fragen zu ermöglichen, haben wir BitterDB gegründet, eine freie und duchsuchbare Datenbank von bitteren Stoffen. BitterDB enthält aktuell über 550 bittere Moleküle, aus der Literatur sowie dem Merck Index, und ihre zugehörigen 25 menschlichen Bittergeschmacksrezeptoren (ht2R). BitterDB bietet verschiedene Möglichkeiten, die bittere Welt zu untersuchen: Die Suche nach bitteren Verbindungen nach verschiedenen Kriterien und die Suche nach bitteren Molekülen mit ähnlicher Struktur zur angefragten Verbindung, BLAST von Bitterrezeptoren und mehr. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
The human genome seems to encode for not more than 30,000 to 40,000 proteins. A major challenge is to understand how posttranslational events, such as glycosylation, affect the activities and functions of these proteins in health and disease. The importance of protein glycosylation is becoming widely realized through studies on protein folding, protein localization and trafficking, protein solubility, biological half-life as well as studies on cell-cell interactions. The progressing Glycomics projects will dramatically accelerate the understanding of the roles of carbohydrates in cell communication and lead to novel therapeutic approaches for treatment of human disease. The MIT's magazine of innovation (January 21 2003) has identified Glycomics as one of the top ten technologies that will change the future. To support the upcoming Glycomics projects we [German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg] focus our research activities on the development of bioinformatic tools and databases for glycobiology. ... [Information of the supplier]
Sequencing of the human genome has opened the way and provided the impetus for building a comprehensive picture of a mammalian cell. Significant efforts are underway in the fields of genomics and proteomics to identify all genes and proteins in a given organism. The goal is a complete map of the genes, gene products and their interaction networks in a functioning cell. The next step in establishing a comprehensive picture of a cell will be to tie the cell's metabolome into the rapidly developing genomic and proteomic maps. A cell's metabolome, however, is such an enormous and complex entity that characterizing it can only be approached in sections. This consortium is now proposing to focus on the lipid section of the metabolome by developing an integrated metabolomic system capable of characterizing the global changes in lipid metabolites ("lipidomics"). Our consortium has developed a Lipid Metabolites and Pathways Strategy, termed LIPID MAPS, that applies a global integrated approach to the study of lipidomics. ... [Information of the supplier]
Die Website stellt die offizielle Datenbank der Japanischen Konferenz über die Biochemie von Lipiden (JCBL) dar. Die "LipidBank" für das Internet ist demnach eine offene, frei zugängliche Datenbank der natürlichen Lipde inklusive der Fettsäuren, Glycerolipide, Sphingolipide, Steroide und der verschiedensten Vitamine. Die Datenbank enthält mehr als 6000 einzigartige molekulare Strukturen (im ChemDraw cdx oder MDL MOL Format), ihre Lipid Namen (gebräuchlicher Name, IUPAC-Name), Informationen über deren Spektren (Massen-, UV-, IR-, NMR- und weitere Spektren) sowie wichtige Literaturangaben. Die Datenbank enthält ausschließlich natürliche Lipide und wird manuell erstellt sowie redaktionell von Experten in dem Gebiet der Lipidforschung betreut. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Die an der Universität Hamburg gehostete Webpräsenz bietet einen Zugang zum Sammelwerk Landolt-Börnstein in Form eines als Datenbank gestalteten Inhaltsverzeichnisses. Auf die beim Springer-Verlag elektronisch erhältlichen Volltexte wird verlinkt; der Zugang zu den Volltexten setzt eine entsprechende Lizenz voraus. Auch ohne lizenzierten Zugriff auf die Volltexte aus Landolt-Börnstein können umfassende Informationen zu chemischen Stoffen und ihren Eigenschaften abgerufen werden. Insgesamt werden 160.000 organische und anorganische Stoffe hinsichtlich Namen, Molekülstruktur, Chemical Abstracts-Nummer und anderen Identifiern dargestellt. Für viele Stoffe werden Crosslinks zu Derivaten angezeigt. ... [Redaktion vifabio]
MassBank ist das erste öffentlich zugängliche Repositorium für massenspektrometrische Daten, welches zugleich den Austausch solcher Daten innerhalb der Scientific Community ermöglicht. Die Daten in MassBank sind nützlich zur chemischen Identifizierung und zur strukturellen Aufklärung von chemischen Verbindungen, die mittels Massenspektrometrie untersucht wurden. Die Webpräsenz bietet zahlreiche Elemente, darunter eine verteilte Datenbank und hochgradig präzise Massenspektren von biologischen Stoffwechselprodukten. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Das Tumorsuppressorprotein p53 war zunächst als essentiell wichtiger Transkriptionsfaktor nach DNA-Schädigungen erkannt worden. In der Folgezeit wurde klar, dass p53 weitreichendere Funktionen im Zusammenhang mit zellulärem Streß besitzt, etwa bezüglich Onkogen-Aktivierung oder Hypoxie. Das Protein p53 fungiert als tetramerer Transkriptionsfaktor, der in normalen nicht gestressten Zellen in sehr niedrigen Konzentrationen vorkommt. Nach Streß können verschiedene Pfade zu posttranslationalen Modifikationen des Proteins und zu seiner Stabilisierung führen. Die p53 Database enthält mehr als 16.000 Einträge zu TP53-Mutationen, die in Tumoren, in normalen Hautzellen sowie bei nicht krebsartigen Erkrankungen wie rheumatischer Arthritis gefunden wurden. Die Datenbank schließt auch Keimbahn-Mutationen ein, die bei Li-Fraumeni Syndrome (LFS) und bei LFS-artigen Syndromen auftreten. ... [Information des Anbieters, verändert]
SWISS-2DPAGE is an annotated two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2-D PAGE) and SDS-PAGE database established in 1993 and maintained collaboratively by the Biomedical Proteomics Reasearch Group (BPRG) of the Geneva University and the Proteome Informatics Group of the Swiss Institute of Bioinformatics (SIB). The SWISS-2DPAGE database assembles data on proteins identified on various 2-D PAGE and SDS-PAGE maps. Each SWISS-2DPAGE entry contains textual data on one protein, including mapping procedures, physiological and pathological information, experimental data (isoelectric point, molecular weight, amino acid composition, peptide masses) and bibliographical references. In addition to this textual data, SWISS-2DPAGE provides several 2-D PAGE and SDS-PAGE images showing the experimentally determined location of the protein, as well as a theoretical region computed from the sequence protein, indicating where the protein might be found in the gel. Cross-references are provided to Medline and other federated databases. ... [Information of the supplier]
AACompIdent ist ein Werkzeug zur Identifikation von Proteinen anhand ihrer Aminosäuren-Zusammensetzung. Das Werkzeug durchsucht die Swiss-Prot- und/oder TrEMBL-Datenbanken nach denjenigen Proteinen, deren Aminosäuren-Zusammensetzung der gegebenen Zusammensetzung am nächsten kommt. [Information des Anbieters, übersetzt]
Diese Seite erlaubt den Vergleich einer Antikörper-Sequenz mit der Kabat-Datenbank. Alle ungewöhnlichen Aminosäuren, die in weniger als 1% der Sequenzen in der Datenbank vorkommen, werden dem Benutzer angezeigt; dadurch können Klonierungsartefakte und Sequenzierfehler erkannt werden. Die Kabat-Datenbank umfaßt im Moment (März 2007) 6014 leichte Ketten und 7895 schwere Ketten. ... [Information des Anbieters, übersetzt]