Phytozome ist ein Gemeinschaftsprojekt des zum Department of Energy gehörenden Joint Genome Institute (DOE) und des Center for Integrative Genomics, um vergleichende genomische Studien zwischen grünen Pflanzen zu ermöglichen. Familien von orthologen und paralogen Genen, die die modernen Nachkommen von Ur-Gen-Sätzen repräsentieren, wurden auf phylogenetischen Schlüsselknoten gebildet. Diese Familien erlauben einen einfachen Zugang zu stammspezifischen Orthologie/Paralogie-Beziehungen, wie auch zu stammspezifischen Genen und Genexpansionen. Seit der Veröffentlichung der achten Version von Phytozome ermöglicht die Datenbank einen Zugang zu einunddreißig sequenzierten und kommentierten Genomen von Grünpflanzen, die in Genfamilien auf elf evolutionär signifikanten Knotenpunkten gebündelt sind. Wo möglich wurde jedes Gen mit PFAM-, KOG-, KEGG- und PANTHER-Anwendungen kommentiert, und öffentlich zugängliche Kommentare von RefSeq, UniProt, TAIR, JGI wurden verlinkt, und sind suchbar. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
LisBeth ist ein unabhängiges Computerprogramm, das die Three-Item-Analyse (3ia) für kladistische Forschung in der Phylogenetik und der Biogeographie umsetzt. Die Entwicklung der 3ia-Annäherung hat mit den Arbeiten von Gary Nelson, Norman Platnick, Pauline Ladiges (Nelson und Ladiges 1991; Nelson und Platnick 1991; Nelson und Ladiges 1992; Nelson und Ladiges 1996) begonnen. Aktuelle Fortschritte der Methode wurden durch David M. Williams und Malte C. Ebach in Zusammenarbeit mit anderen erzielt. LisBeth ist das einzige Computerprogramm-Paket, welches speziell für die Three-Item-Analyse (3ia), beispielsweise in der Phylogenetik und kladistischen Biogeographie entwickelt wurde. Das LisBeth Graphik-Interface (GUI) ermöglicht die Darstellung von Hypothesen zur Homologie zwischen Arten oder Gebieten direkt als Baumdiagramme oder als Hierarchien, z.B. als verschachtelte Venn-Diagramme. Das GUI wird zum Eintritt, Editieren und Visualisieren der Hypothesen zur Homologie und der Resultate ihrer Kombination durch 3ia verwendet. Es erlaubt eine vollständige Beschreibung von jedem Charakter und jedem Stadium. Es könnte in der Systematik Verwendung finden und wurde für die kladistische Biogeographie adaptiert. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
The molecular revolution has led to an explosion of phylogenetic research that has both confirmed many long-standing hypotheses as well as forcing us to rethink many others. A more recent, associated development is that of divergence-time estimation, resulting in so-called "timetrees". Whereas phylogenies can only present hypotheses of evolutionary relationships and character evolution, timetrees add an important temporal component to expand our research questions to include investigations of what historical events might have helped drive the evolution of a given structure or taxon. Although all divergence-time estimates are ultimately based on fossil information (including paleogeographic events), the coupling of these data with DNA sequence data has led to a much more comprehensive set of estimates, given that the fossil record alone can only date a subset of the nodes in a tree and often not as precisely as desired. Whereas molecular phylogenetics is well established in Germany, research into timetrees is in its comparative infancy with respect to both its methodological and applied, empirical aspects. Instead, much of the initiative in this area comes from outside of Germany. By presenting a symposium covering diverse aspects of timetrees, we hope to stimulate interest in this developing field of phylogenetics. ... [Information of the supplier]
The Botanic Garden and Botanical Museum Berlin and the Museum für Naturkunde Berlin are glad to welcome you to the 2016 GGBN conference, held from June 21 through June 24, 2016, in Berlin, Germany. The Global Genome Biodiversity Network is a collaborative effort to cryo-preserve and provide access to genomic samples from across the Tree of Life. Sessions and Workshops are planned on: Concerted collecting and sampling strategies to preserve the Tree of Life; Sampling the lost world in Natural History collections; Nagoya Protocol: consequences and solutions; Knowledge exchange: natural history meets applied biobanking; and Implementing GGBN standards and best practices. ... [Information of the supplier]
Phylogenetics is concerned with what is probably the most important problem in biology: reconstructing the evolutionary history of present-day organisms from molecular data, such as DNA, or morphological characters. Hidden from view, in phylogenetics software packages used by biologists, are algorithms implementing stochastic and combinatorial methods on binary trees, as well as more general network structures. The mathematics involved represent a unique confluence of probability theory, discrete mathematics, stochastic methods, and statistical inference, as well as algebraic methods such as group theory. There are many important theoretical and practical problems that arise, such as statistical identifiability of models, consistency and convergence of methods. These problems can only be solved using a multi-disciplinary approach. Phylomania brings together internationally recognised experts, with the aim of discussing the pressing research problems in phylogenetics. ... [Information of the supplier]
Das diesjährige Symposium wird eine zentrale Frage der Evolutionsbiologie behandeln: Was bestimmt die Form von Strukturen? Wieso sehen Tiere, Pflanzen und ihre Organe so aus, wie sie aussehen? Meist wird die Antwort (die Ebene der Kausalität) den Feldern der Synthetischen oder Erweiterten Evolutionstheorie bzw. auf Strukturebene oft auch der Evolutionären Entwicklungsbiologie zugeordnet. Damit bleiben aber andere Aspekte der organismischen Evolutionsbiologie außen vor. Unter dem Konzept der ‚Evolutionären Morphologie‘ haben wir versucht, kausale Bedingtheiten der Vielgestaltigkeit des Lebens zusammenzufassen. Das genaue Label spielt natürlich gar keine Rolle, aber diejenigen, die fasziniert von der Vielgestaltigkeit des Lebens sind, sind aus unserer Sicht eigentlich immer auch „Morphologen“. Die Eingangsfrage erscheint also gerade in Zeiten der Dominanz funktionell-genomischer Sichtweisen interessanter denn je. Das kommende „Phylogenetische Symposium“ soll sich dieser Frage widmen. Die Themen der Vorträge umfassen so unterschiedliche Aspekte wie Form/Funktion, Evo-Devo, Ökomorphologie, Sexuelle Selektion, Koevolution, und Phylogenetische Bürde. ... [Information des Anbieters]
Open Tree of Life aims to construct a comprehensive, dynamic and digitally-available tree of life by synthesizing published phylogenetic trees along with taxonomic data. The project is a collaborative effort between 11 PIs across 10 institutions. Funding is from NSF AVAToL #1208809. Browse the tree and leave feedback: Click on nodes to move through the tree, and click on nodes or edges to see more information about taxonomies and phylogenies that contain / support that node. If you have feedback about the relationships that you see, use the "Add Comment" button. Contribute data: You can contribute to the synthetic tree by uploading trees through our curation interface. These can be trees from TreeBASE or trees uploaded from your computer. There will be a delay before uploaded trees appear in the synthetic tree. Up to summer 2015, the release cycle has been months between new versions of the synthetic tree, but this should shorten in the future. ... [Information of the supplier]
Ökologie und Evolution versuchen, die Diversität des Lebendigen zu verstehen, einschließlich der Diversität von Arten, ihres genetischen Inventars, der Diversität von Funktionen, Interaktionen und Artengemeinschaften, wie Arten und Artengemeinschaften evolvieren, sich ausbreiten und vergehen. Viele neue Ideen und methodische Ansätze werden gegenwärtig in dem Feld entwickelt, wo sich diese beiden Disziplinen begegnen. Das betrifft sowohl die Ebene der Mikro- als auch der Makroevolution, beispielsweise die Untersuchung der Entstehung von Biodiversitätshotspots, die Auswirkungen von Klimawandel auf die Verbreitung und evolutive Adaptation von Arten und Artengemeinschaften oder genomweite Analysen adaptiver Merkmale in Populationen. Präsentiert werden jüngste Fortschritte in der Evolutionsökologie, ihre Bedeutung für die Phylogenetik und Biodiversitätsforschung, und umgekehrt. Als Rednerinnen und Redner zugesagt haben: Alexandre Antonelli (Göteborg), Christoph Bleidorn (Madrid), Erika Edwards (Providence, Rhode Island), Susanne Fritz (Frankfurt), Catherine Graham (New York), Christian Lexer (Wien), Susanne Renner (München), Marten Winter (Leipzig). Poster-Präsentationen von Studierenden und Postdocs sind willkommen! Die Deadline für die Einreichung von Abstracts ist der 15. September 2016. Bitte senden Sie Ihre Abstracts an Martin Schlegel. Bitte registrieren Sie sich online. Für das Symposium werden keine Teilnahmegebühren erhoben! Wir freuen uns, Sie bald in Leipzig willkommen zu heißen! ... [Information des Anbieters]
