Die Arabidopsis Information Resource (TAIR) führt eine Datenbank mit den genetischen und molekularbiologischen Daten für den Modellorganismus und Vertreter der Höheren Pflanzen, Arabidopsis thaliana. Die durch TAIR verfügbaren Daten beeinhalten die komplette Genomsequenz mit der genetischen Struktur, Informationen über Genprodukte, Stoffwechsel, die Genexpression, DNA und Samenbestände, Genomkarten, genetische und physiologische Marker, Publikationen und Informationen zu der Arabidopsis Forschungsgemeinde. Die Daten über die Funktionen einzelner Genprodukte werden anhand von neuester publizierter Literatur und Eingaben der Gemeinschaft alle zwei Wochen aktualisiert. Genstrukturen werden 1-2 mal pro Jahr mittels Computergestützter und manueller Methoden sowie durch Eingaben der Gemeinde zu neuen Genen aktualisiert. TAIR bietet zudem von den gefundenen Datensätzen aus auch eine ausführliche Weiterverlinkung zu anderen Arabidopsis Resourcen im Netz. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
BrassiBase ist ein sich entwickelndes, online zugängliches Wissens- und Datenbanksystem zu querverwiesenen Informationen und Ressourcen zu Brassicaceae (Cruciferae), einschließlich Taxonomie, Systematik und Evolution, Chromosomenzahlen, Eigenschaften und Charakteristika, Protoplasma-Ressourcen und exakter Aufzählung aller Arten, Gattungen und Stämme. Biologisches, molekulares und evolutionäres Wissen wächst in der Ackersenf-Familie (Kreuzblütler) exponentiell. Wegen der komplexen und überwältigenden biologischen Diversität der Familie, ist es schwierig Forschungsergebnisse innerhalb eines größeren evolutionären Rahmens zu bewerten. Viele Arten haben sich als bemerkenswerte Forschungsobjekte hervorgetan, aber sind kaum zugänglich. Biologisches Material und Ressourcen, sowohl direkt in der Wildnis gesammelt als auch in Keimgewebe-Sammlungen, wurden oft taxonomisch falsch deklariert, und nur sehr selten wurde dieses Material weiter charakterisiert und dokumentiert. Zudem gibt es keine Gesamtbetrachtung von Charakter- und Eigenschaftsverbreitung innerhalb der Brassicaceae-Linie. Um diese Lücken zu schließen, machen wird die Forschungsdaten, die sich auf die adaptiven Charakteristika und ihre Evolution innerhalb der Brassicaceae zugänglich. In diesem Zusammenhang stellen wir zudem eine umfassende Dokumentation der Taxonomie und Systematik der ganzen Familie zur Verfügung. Dies wird eine Datenbank mit der gesamten relevanten taxonomischen, systematischen und phylogenetischen Literatur, eine umfassende Datensammlung zu Charakteristika und Eigenschaften, ein auf DNA basierendes Identifikations-Tool für Gattungen und Arten, elektronische Interaktive Keys für die Identifikation von Gattungen und Arten und ein Setup einer sorgfältig ausgewählten und dokumentierten Keimgewebe-Sammlung für die Hauptlinien der Familie. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
RadishBase ist eine Datenbank zu Genom und Genetik des Rettichs. Rettich (Raphanus sativus L., 2n = 2x = 18) gehört zur Familie Brassicaceae und ist eine ökonomisch wichtige Anbaupflanze, die weltweit konsumiert wird, nicht zuletzt auch in Ostasien. [Information des Anbieters, übersetzt]
WormBase ist ein internationals Konsortium aus Biologen und Computerwissenschaftlern, die sich zum Ziel gesetzt haben, die Wissenschafts-Community mit akkuraten, aktuellen und zugänglichen Informationen über die Genetik, das Genom und die Biologie von C. elegans und einigen verwandten Nematoden zu versorgen. [Information des Anbieters, übersetzt]
The cyclic AMP response element (CRE)-binding protein (CREB) family of activators (CREB1, CREM, ATF1) functions in diverse physiological processes, including the control of cellular metabolism, growth-factor-dependent cell survival, and developement an plasticity of neurons. A diverse range of signals, including cAMP, calcium, stress and mitogenic stimuli, can activate CREB and promote target gene expression. This database is dedicated to catogerize CREB target genes in a comprehensive and easy-to-search way. We have used a multi-layered approach to predict, validate and chracterize CREB target genes. For each gene, we try to provide the following information: 1. CREB binding sites on the promoters, 2. Promoter occupancy by CREB, 3. Gene activation by cAMP in tissues. The data are for humans, rats, and mice. ... [Information of the supplier, modified]
The Genetic Association Database is an archive of human genetic association studies of complex diseases and disorders. The goal of this database is to allow the user to rapidly identify medically relevant polymorphism from the large volume of polymorphism and mutational data, in the context of standardized nomenclature. ... [Information of the supplier]
T1DBase is a public website and database that supports the type 1 diabetes (T1D) research community. It is being created by a joint effort between the Institute for Systems Biology, Juvenile Diabetes Research Foundation/Wellcome Trust Diabetes and Inflammation Laboratory and the Juvenile Diabetes Research Foundation International. T1DBase collects information from public sources and from collaborating laboatories, integrates this information, and presents it in a form that is useful for T1D researchers. The current data scope includes annotated genomic sequences for suspected T1D susceptibility regions; microarray data; functional annotation of genes active in beta cells; and "global"datasets, generally from the literature, that are useful for systems biology studies. ... [Information of the supplier, modified]
FlyView ist eine Bilddatenbank zur Entwicklung und Genetik von Drosophila, die sich speziell mit den Expressionsmustern von Enhancer trap-Linien und klonierten Genen befasst. Unser Ziel ist es, Bilder auf dem Computerbildschirm vergleichen und so nach speziellen Mustern in unterschiedlichen Entwicklungsstadien suchen zu können. In FlyView gibt es drei Suchmöglichkeiten: Die Suche nach Mustern (über Stichwörter, wobei die Treffer als Photos mit einem Link zu den zugehörigen Linien angezeigt werden), die Suche nach Linien (über Stammnummer, Allel, Genotyp, Chromosom, Insertionsstelle, Lebensfähigkeit, Entwicklungsstadium oder Expressionsmuster; die Treffer werden aufgelistet und sind mit Vollbeschreibungen verlinkt (zu denen auch Photos, E-Mail-Bestelladressen und – im Fall der BDGP-Linien – Links zu FlyBase und/oder EoDf gehören)) und der Überblick (dahinter verbirgt sich eine aktuelle Liste aller Linien mit einer Verlinkung auf die zugehörigen Beschreibungen und Photos). Der Erfolg dieser Datenbank hängt ausschließlich von der Aktivität der Drosophila-Gemeinde ab. Alle Drosophila-Forscher sind eingeladen, durch die Übermittlung von Photos und Beschreibungen zu dieser Datenbank beizutragen. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Diese Datenbank enthält die aktuellen Ergebnisse der „Large scale protein trapping“-Screens mit Informationen über die exprimierenden Zellen und zur subzellulären Lokalisation der GFP-markierten Proteine. Sie enthält die Sequenzkoordinaten inserierter Transposons, Informationen über die markierten Gene und Photos der GFP-Expressionsmuster. FlyTrap fungiert als ein Datenspeicher für die Linien der Arbeitsgruppen Chia, Cooley und Spradling. Alle aufgelisteten Linien (Drosophila)können auch bestellt werden. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Das ZFIN ("Zebrafish Information Network") bietet Zugriff auf Datenbanken für den Zebrafisch als Modellorganismus. Die Fernziele des ZFINs umfassen a) Datenbank-Resourcen für den Laboreinsatz des Zebrafisches zu entwickeln b) entwicklungsbiologische, genetische und genom-relevante Zebrafisch-Informationen bereitzustellen c) Referenz-Datensätze der Zebrafisch-Forschung zu pflegen d) diese Informationen mit korrespondierenden Daten aus anderen Modellorganismen und Human-Datenbanken zu verknüpfen e) den Einsatz des Zebrafisches als ein Modell für die Humanbiologie zu vereinfachen und f) den Erfordernissen der Forschergemeinschaft nachzukommen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]