During three days in October established leaders of the field and younger scientists will come together to discuss important aspects of the wide field of "Molecular Transport" in a relaxed atmosphere. Besides lectures given by invited speakers, there is ample room for additional oral presentations and posters. An exhibition of support from industry will complement the meeting. A number of social events will allow for further discussions. To keep the meeting manageable and to allow for intense discussions in a relaxing atmosphere the number of participants will be restricted to a maximum of 220. ... [Information of the supplier]
Die DistiLD-Datenbank zielt darauf ab, den Nutzen existierender Ergebnisse genom-weiter Assoziationsstudien (GWAS) zu erhöhen, indem sie es einfacher macht krankheits-asoziierte SNPs und Gene in ihrem chromosomalen Kontext zu suchen und sichtbar zu machen. Die Datenbank führt drei wichtige Aufgaben durch: Publizierte GWAS werden von verschiedenen Quellen gesammelt und mit standartisierten, internationalen Krankheitscodes (ICD10 Codes) verknüpft. Zudem werden Daten des Internationalen HapMap-Projekts analysiert um "linkage disequilibrium"(LD)-Blocks zu definieren, auf denen SNPs und Gene abgebildet sind. Drittens macht es das Web-Interface leicht, krankheits-assoziierte SNPs und Gene innerhalb LD-Blocks zu suchen und zu visualisieren. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Die DNAtraffic-Datenbank ist eine einzigartige, umfassende und ausführlich kommentierte Datenbank der Genomdynamiken während des Lebens einer Zelle. DNAtraffic enthält umfangreiche Daten zur Nomenklatur, Ontologie, Struktur und Funktion von Proteinen, die bei der Kontrolle der DNA-Integritätsmechanismen eine Rolle spielen. Diese Daten sind z.B. Chromatin-Remodelling, DNA-Reparatur und die Antwort auf DNA-Schäden von 8 Modellorganismen, die häufig in Studien zur DNA verwendet werden: Homo sapiens (Mensch), Mus musculus (Maus), Drosophila melanogaster (Fruchtfliege), Caenorhabditis elegans (Nematode), Saccharomyces cerevisiae (knospende Hefe), Schizosaccharomyces pombe (Spalthefe), Escherichia coli K-12, Arabidopsis thaliana (Acker-Schmalwand). DNAtraffic enthält vergleichende Informationen zu Krankheiten, die in Verbindung mit gefalteten menschlichen Proteinen stehen. Die Datenbank wird oft im Zusammenhang mit systematischen Informationen der Nomenklatur, Chemie und Struktur von DNA-Schäden und Drug-targeting Nukleinsäuren und/oder Proteinen, die in die Aufrechterhaltung der Genomstabilität involviert sind, zitiert. Eines der Ziele der Datenbank ist die Schaffung der ersten Plattform für die kombinatorische Komplexität der DNA-Metabolismus-Analyse. Sie enthält Illustrationen von Stoffwechselwegen, Schäden, Proteinen und Wirkstoffen. Da DNAtraffic designed wurde um ein großes Spektrum an wissenschaftlichen Disziplinen abzudecken, ist es großflächig mit einer Vielzahl von Datenquellen verknüpft. Die Datenbank ist frei erhältlich und kann nach Name des DNA-Netzwerkprozesses, DNA-Schaden, Protein, Krankheit und Wirkstoff durchsucht werden. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Die Mausphänotyp-Datenbank (MPD; phenome.jax.org) charakterisiert Stämme von Labormäusen, um translationale Entdeckungen zu ermöglichen und in der Wahl der Mausstämme für experimentelle Studien zu assistieren. Wir sind eine Forschungsgruppe am Jackson Laboratory. Datensätze werden freiwillig durch Wissenschaftler von einer Vielzahl von Institutionen und mit verschiedenartigen Hintergründen zur Verfügung gestellt, oder manchmal durch uns aus öffentlichen Quellen zusammen getragen. MPD hat drei große Typen von stamm-spezifischen Datensätzen: Phänotyp-Stamm-Suche, SNP und Variationsdaten, und Genexpressions-Stamm-Überblicke. MPD sammelt Daten von klassischen durch Inzucht erzeugten Stämmen, wie auch jeden "fest-genomischen" Stamm und Derviate, die öffentlich durch öffentliche Forscher erworben werden können. Stämme können aus JAX-Mice oder jedem anderen Anbieter sein. Forscher, die einen diversen Satz von klassischen Stämmen testen wollen, sollten unsere MDP-Priotitäts-Stammsätze in Betracht ziehen. Aktuell subventionieren oder assistieren wir nicht bei der Beschaffung von Mäusen für Projekte. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Das SEQanswers Wiki, welches sich mit Sequenzierung und Sequenzierungstechnologien beschäftigt, ist ein SemanticMediWiki (SMW), das von Mitgliedern der SEQanswers Community bearbeitet und erneuert wird. Das Wiki liefert einen umfangreichen Katalog von manuell kategorisierten Analyse Tools, Technologien und Informationen über Service Provider. In zwei Jahren hat die SEQanswers Community Seiten für über 400 Software Tools kreiert und diese mit ca. 350 Literatur Referenzen und 500 Weblinks assoziiert. SEQwiki besteht aus Daten über 578 bioinformatische Anwendungen, 484 Referencen und 753 URLs. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
YetFaSCo steht für Yeast Transcription Factor Specificity Compendum. Es ist eine Sammlung von allen verfügbaren TF-Spezifitäten für die Hefe Saccharomyces cerevisiae in Position Frequency Matrix (PFM)- oder Position Weight Matrix (PWM)-Formaten. Mit diesem kann man Sequenzen mit der Absicht, die Lage potenzieller Bindungsstellen herauszufinden, scannen, vorher errechnete genomweite Bindungsstellen näher betrachten, herausfinden, welche TFs ein ähnliches Motiv aufweisen wie das bereits gefundene, und eine Sammlung von Motiven herunterladen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Bluejay ist ein Satz von Java-Objekten für die Bearbeitung, Anzeige und Suche von XML-kodierten linear scale data. Die Grundlage für die Analyse unserer Anwendung sind genetische und Protein-Sequenzen, wo Features irgendwo auf lineare Moleküle zurückgehen. Bluejay wächst mit dem Ziel, einen graphischen Viewer von genetischen Daten mit point-and-click-data-mining-Funktionalitäten zu erschaffen, so wie die, die durch einen Standard-Webbrowser verfügbar sind. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
“Multi-purpose Automated Genome Project Investigation Environment” (MAGPIE, http://magpie.ucalgary.ca/) ist ein Softwarepacket für die automatisierte Verwaltung und Präsentation von DNA- und Proteinsequenzen. MAGPIE filtert die Ergebnisse verschiedener Datenbanksuchergebnisse auf jede Sequenz (z.B. exprimierte Sequenz-Taqs, ESTs) oder Untersequenzen (z.B. offenes Leseraster, ORFs, in bakterieller genomischer DNA), und zeigt sie auf einer Zusammenfassungsseite, die Interpretationen der biologischen Rolle von Genen und Origins ermöglicht, an. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
The 2013 IMB Conference will be the first major European meeting to focus on the latest findings and concepts in the fields of chromatin dynamics and stem cells. As such it will bring together experts in epigenetics, developmental biology and cellular reprogramming. The conference will be of interest both to researchers performing basic research in these fields and to applied scientists interested in cellular reprogramming and translational medicine. The conference is open to anyone interested. ... [Information of the supplier]
Für das Erreichen eines besseren Verständnisses des Spleiß-Prozesses und seiner Funktionen ist, eine umfassende Kenntnis aller Faktoren des Spleißens von Proteinen und von RNA und ihrer Wechselwirkungen miteinander entscheidend. Ein großer Teil der relevanten Informationen ist in der Literatur vergraben oder in vielen unterschiedlichen Datenbanken verfügbar. Durch von Hand kuratierte Screenings von Literatur und Datenbanken haben wir experimentell bemessene Daten von 71 menschlichen RNA-bindenden, das Spleißen regulierenden Proteinen erfasst und sie in einer Datenbank namens "SpliceAid -F" organisiert. Diese Datenbank stellt für jeden Spleißfaktor (SF) seine funktionellen Domänen und seine Protein- und chemischen Interaktoren bereit. Außerdem haben wir experimentell validierte RNA-SF-Wechselwirkungen, einschließlich der relevanten Informationen zu den RNA -Bindungsstellen der Gene erfasst, also bestimmt wo diese liegen, ihre genomischen Koordinaten erfasst, die Spleiß Effekte bestimmt, experimentelle Verfahren festgehalten, sowie die entsprechenden Literaturangaben erfasst. ... [Information des Anbieters, übersetzt]