ModelDB ist eine kuratierte Datenbank publizierter Modelle für die gesamte Breite der computergestützten Neurowissenschaften. Sie reagiert auf den Bedarf an Zugang zu solchen Modellen, um deren Validität zu prüfen und die Anwendung zu fördern. Die Datenbank kann mit computergestützten Modellierungen in beliebigen textlichen Formen umgehen, einschließlich prozeduraler oder deklarativer Programmiersprachen (z. B. C++, XML-Dialekte) und Quellcode für jedwede Simulations-Umgebungen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Omics studies, such as those of genomics, transcriptomics, proteomics, epigenomics and metabolomics, have accumulated a large volume of biomedical data. However, the promise to translate these “big data” into biomedical knowledge can be realized only if they are standardized to be interoperable, complete to ensure data integrity, and consistent in data content. Biocuration provides tools and procedures critical in realizing the promise. International Biocuration Conference (IBC) is the global discussion platform for biocurators, bioinformaticians, data scientists, as well as any biomedical researchers and practitioners who care about data quality and interoperability, and interested in the exploration of a great application potential by data-driven knowledge discovery It is our great pleasure to announce that the 8th International Biocuration Conference (IBC) will be held in April 23-26, 2015, at Beijing Friendship Hotel, Beijing, China. The newly assembled Organizing Committee, consisting of not only local organizers, but also of members from Executive Committee of International Society for Biocuration and the 7th IBC Organization Committee, will start to work out the details to repeat previous success in the delivery of great scientific program, intuitive and functional logistics. ... [Information of the supplier]
CourseWare ist ein Simulator, der es Studenten ermöglicht u.a. mit voreingestellten Szenarien mathematische Experimente am Bildschirm durchzuführen. Vorhandene Simulatoren, die einfach zu verändern sind oder genutzt werden können wie sie sind, gibt es u.a. zu folgenden Themen: Fraktale, Waldsukzession und -zerfall, Nahrungsketten, Räuber-Beute-Beziehungen, Bevölkerungswachstum. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
PHYLIP ist ein freies Paket von Programmen, um aus Ergebnissen Stammbäume abzuleiten. Es wird als Quellcode, als Dokumentation und in einer Vielzahl von unterschiedlichen Anwendungstypen vertrieben. Diese Website beinhaltet Informationen über PHYLIP und die Wege des Transfers von Anwendungen, Quellcode und Dokumentation zum eigenen Computer. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Zwei Ziele des MSU Digital Evolution Laboratory sind: digitale Organismen zu untersuchen, um das Verständnis der natürlichen Evolution zu fördern und dann dieses Wissen anzuwenden, um computerbedingte Probleme zu lösen. Ein Großteil der Arbeit des Devolabs konzentriert sich auf die Forschung mit und die kontinuierliche Weiterentwicklung der digitalen Evolutionsforschungsplattform Avida. In Avida wird eine Population von sich selbst replizierenden Computerprogrammen externen Belastungen (wie Mutationen und begrenzten Ressourcen) ausgesetzt und natürlicher Auslese unterworfen. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Diese Site bietet zwei Ressourcen zu mathematische Modellen in der Ökologie: Register of Ecological Models (REM) und ECOBAS. REM ist eine Meta-Datenbank für schon bestehende mathematische Modelle in der Ökologie. Das ECOBAS Projekt ist ein System zur Dokumentation von mathematischen Beschreibungen von ökologischen Prozessen, das auch über eine Datenbank recherchierbar ist. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
CellML beruht auf der XML Markup Language, einer erweiterbaren Computersprache zur Darstellung hierarchischer Strukturen einer Textdatei. Die CellML- Sprache wurde vom Bioengineering Institute der Universität von Auckland und angegliederten Forschungsgruppen entwickelt. Der Zweck von CellML liegt darin, computergestützte Modelle zu speichern und auszutauschen. CellML erlaubt den Wissenschaftlern auch den Austausch von Modellen, z.B. von Protein-Modellen, die mit unterschiedlichen Modellierungs-Tools erstellt wurden. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
MIRIAM ist ein Vorhaben zur Standardisierung der "Minimal Information Required In the Annotation of Models", mit dem Ziel, dass verschiedene Arbeitsgruppen beim Annotieren und kuratieren von Computermodellierungen in der Biologie zusammenarbeiten können. [Information des Anbieters, übersetzt]
Die Phenoscape-Informationsbank ist ein Expertensystem, welches die Breitbandanalyse von phänotypischen Variationen quer durch die Taxa sowie die Co-Analyse dieser evolutionär variablen Eigenschaften mit den phänotypischen Mutanten von Modelorganismen ermöglicht. Jahrzehnte vergleichender anatomischer Studien haben zu einer ergiebigen Gesamtheit an „Freitext“-Daten geführt. So wie diese Daten wachsen, wird es zunehmend schwierig, sie anzugleichen sowie durch die taxonomischen Gruppen darzustellen; und aufkommende Fragen, welche die entwicklungsgemäße und genetische Grundlage evolutionärer Veränderungen in der Morphologie betreffen, können nicht einfach oder effizient angesprochen werden. Um diesen Umfang an vergleichenden anatomischen Daten in einen entwicklungsgenetischen Kontext zu analysieren, müssen sie zu erst computertauglich umgesetzt werden. Dies kann erreicht werden durch den Gebrauch von Ontologien, beschränktes, strukturiertes Vokabular mit logischen Verwandtschaften zwischen den Begriffen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
NRCAM, die National Resource for Cell Analysis and Modeling, entwickelt mit "Virtual Cell" eine einzigartige Software-Umgebung für Modellierungen und zellbiologische Forschungen. Dabei werden Ansätze der computergestützten Zellbiologie mit hochauflösender Lichtmikroskopie in Verbindung gebracht, um das Zusammenwirken von experimentellen Manipulationen und Computersimulationen spezifischer zellulärer Funktionen zu verbessern; dabei können sowohl einfach molekulare Motoren als auch komplexe Prozesse in Geweben analysiert werden. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
