In Bakterien sind kleine (~30-500 nt) nicht-kodierende RNAs (sRNAs ) die häufigste Klasse von post- transkriptionellen Regulatoren, die in vielfältigen Prozessen einschließlich dem Quorum Sensing, der Stress-Reaktion, der Virulenz und dem Kohlenstoff-Metabolismus beteiligt sind. Basierend auf den Zielmolekülen können sRNAs in zwei große Gruppen unterteilt werden: (i) mRNA bindende Antisense sRNAs und (ii) Protein bindenden sRNAs. Die Antisense-RNAs können außerdem als cis codierte Antisense-sRNAs, die vollständig komplementär zu ihren Zielen sind, und trans codierte Antisense-sRNAs, die nur teilweise komplementär zu ihren Zielen sind, kategorisiert werden. In jedem Fall kann die Wechselwirkung zwischen Antisense-RNA und Ziel-mRNA eine Vielzahl von biologischen Regelkreisen lenken. Jüngste Entwicklungen in High-Throughput- Techniken, wie genomische Tiling Arrays und RNA-Seq, haben unschätzbare Einblicke in die Erkennung und Charakterisierung von bakteriellen sRNAs geliefert. Allerdings steht eine umfassende bakterielle sRNA Datenbank noch nicht zur Verfügung, vor allem für die Integration und Analyse von Hochdurchsatz-Sequenzierungs Daten. Deswegen haben wir die Datenbank BSRD (bakterielle regulatorische RNA Database) entworfen und aufgebaut, welche sRNAs aus über 783 Bakterienarten und 957 Stämmen zur Verfügung stellt. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
