Der Abbau von Xenobiotika und anderen toxischen Substanzen durch Mikroorganismen ist ein zentraler Aspekt der Strategien für die mikrobiologische Sanierung kontaminierter Lebensräume. Das "Center for Microbial Ecology" der Michigan State University und der Rutgers University iniziierten eine Studie zur Etablierung der phylogenetischen Verteilung von beschriebenen, biodegradierenden Mikroorganismen mit dem Ziel der Identifikation von Mustern innerhalb mikrobieller degradativer Prozesse in einem phylogenetischen Kontext und zur Gewinnung von Erkenntnissen zur Evolution dieser Prozesse. Diese andauernden Bemühungen wurde durch Bakterienstamm-Daten, welche schwierig zusammen zu tragen und oft zwischen den Bakterienstämmen nicht vergleichbar sind, erschwert, und unterstreicht die potentielle Nützlichkeit einer Datenbank, die solche mikrobiellen Daten auf Stamm-Ebene zusammenbringt. Um diese Notwendigkeit anzusprechen und eine solche Ressource für die Wissenschaftsgemeinde bereit zu stellen, haben wir die Biodegradative Strain Database (BSD) entwickelt. Sie soll einen schnellen Zugang zu vergleichenden Daten von bekannten biodegradativen Mikroorganismen und der gefährlichen Substanzen, die diese abbauen, festigen und ermöglichen. Somit soll BSD vergleichende Analysen ermöglichen und Wissenslücken in diesem Gebiet aufzeigen. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
MeRy-B ist eine Pflanzenmetabolom-Plattform, die es ihren Nutzern erlaubt, metabolische NMR-Profile von Pflanzen abzulegen und zu visualisieren. MeRy-B ist eine web-basierende Applikation mit öffentlichem und privatem Zugang. Sie wurde entwickelt, um das Wissen von kuratierten Pflanzenprofilen und Metaboliten unter Einbeziehung von NMR zu erweitern, die Daten abzufragen und zu visualisieren, Biomarker mittels Visualisierung der Spektren und statistischer Werkzeuge zu detektieren und bei der Biomarker-Identifikation zu assistieren. Die Plattform enthält Pflanzenmetaboliten und Listen unbekannter Stoffe mit Information über experimentelle Bedingungen und Metabolitkonzentrationen von verschiedenen Pflanzenarten, welche aus Tausenden von kuratierten und kommentierten NMR-Profilen vieler Organe oder Gewebe zusammengetragen wurden. Um Daten hochladen zu können, kontaktieren Sie bitte den Administrator. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Die Yeast Metabolome Database (YMDB) ist eine manuell gepflegte Datenbank für kleine Molekülmetaboliten, die in Saccharomyces cerevisiae gefunden oder produziert wurden. Diese Datenbank behandelt Metaboliten, die in Büchern, wissenschaftlichen Journalen, metabolischen Rekonstruktionen oder anderen elektronischen Datenbanken beschrieben werden. YMDB enthält Metaboliten, die sowohl bei normalem Saccharomyces cerevisiae-Metabolismus unter definierten Bedingungen im Labor als auch Metaboliten, die in Saccharomyces cerevisiae vorkommen, wenn es zum Backen oder zur Produktion von Wein, Bier oder anderen Spirituosen benutzt wird. YMDB enthält derzeit 2027 kleine Moleküle mit 857 assoziierten Enzymen und 138 assoziierten Transportern. Jedes kleine Molekül hat 48 Datensätze, die das Molekül, seine chemischen Eigenschaften und Links zu spektralen und chemischen Datenbänken beschreiben. Jedes Enzym/jeder Transpoter ist verbunden mit seinem assoziierten Metaboliten und hat 30 Datensätze, die sowohl das Gen als auch das korrespondierende Protein beschreiben. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
