The MicrobesOnline genome database contains over 300 prokaryotic genomes. All genomes are automatically analyzed through the VIMSS genome pipeline. We use publicly available sequence analysis tools and databases to search for homologs (NCBI BLAST, SwissProt, COG) and protein domains (InterPro), to assign gene ontologies (Gene Ontology Consortium) and EC numbers and to map the metabolic pathways (KEGG). We then link the orthology relationships between genes, predict operon structures and regulon networks. Most of the genomes are downloaded from NCBI and genes are parsed from GenBank files. When an incomplete genome is directly downloaded from a sequencing center, we predict protein coding genes using CRITICA and Glimmer, tRNA genes using tRNAscan and other RNA genes by BLASTn. All of the info in the VIMSS genome database is freely available on our website. ... [Information of the supplier]
xBASE ist eine Datenbank für vergleichende Genom-Analyse von Bakterien-Genomsequenzen mit besonderem Augenmerk auf Organismen mit Bedeutung für die Lebensmittelwirtschaft. Das Projekt wurde ursprünglich 2002 von Roy Chaudhuri und Mark Pallen der Universität Birmingham als ein Teil des von der BBSRC geförderten Exploiting Genomics Konsortiums (ExGen) konzipiert. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Auf der Halbinsel Kamtschatka im Osten Sibiriens, in einem inaktiven Vulkan, genannt die Uzon-Caldera, sind die dampfenden heißen Quellen des Kamchatka Microbial Observatory ein natürliches Labor zum Studium von Extremophilen. Wissenschaftler aus der ganzen Welt forschen in diesem abgelegenen und unentwickelten vulkanischen Tal. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Microbial Life - Educational Resources (MLER) möchte eine zeitgemäße und sich erweiternde Quelle der Information von Experten über Ökologie, Diversität und Evolution von Mikroorganismen für Studenten, Lehrer, Universitätslehrkörper sowie das allgemeine Publikum anbieten. [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Die Achaeal Genome Browser wurde von Mitgliedern des “Lowe Labs” an der University of California Santa Cruz (UCSC), mit maßgeblicher Unterstützung durch die UCSC Human Genome Browser Group entwickelt. Die Archaeal Browser werden mit einer leicht modifizierten Version des "Human Genome Browser Systems" betrieben. Darüber hinaus sind Extremophile und andere Modellbakterien über das Haupt-Genom-Menü verfügbar. Neue Arten werden hinzugefügt, sobald sie öffentlich werden und auf Nachfrage. Starten Sie mit dem Browsen durch Klick auf eine Art im Stammbaum der Archaea, wählen Sie eine Art in der Genom-Tabelle aus oder gehen Sie direkt zum Genom-Menü. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Im 21.ten Jahrhundert wird es für Studenten immer wichtiger werden, grundlegende biotechnologische und mikrobiologische Konzepte zu verstehen. Diese wissenschaftlichen Theorien werden, wie so oft, am besten durch Sammeln von Laborerfahrungen in der Praxis vermittelt. Diese Laborexperimente sind jedoch eine Herausforderung, bedeuten sie doch, die Studenten dem Risiko von schädlichen Mikroben und Chemikalien auszusetzen, Sterilkulturen aufrechtzuerhalten sowie Kosten-, Material- und Zeitaufwand für die Experiment-Vorbereitungen einplanen zu müssen. Um daher dem dringenden Bedarf für die biotechnologischen und mikrobiellen Komponenten der Lehrpläne mit neuartigen, sicheren und effektiven Lösungen nachzukommen, wurde von uns diese Website konzipiert. Im Zentrum des Projektes steht als idealer Lern-und Modellorganismus das halophile Bakterium Halobacterium der Art NRC-1, welches seit 20 Jahren bereits intensiv in unserem Labor erforscht wurde. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Aspergillus flavus ist ein pathogener Pilz, der Pflanzen, Tiere und Menschen befallen kann und das Carcinogen Aflatoxin produziert. Ein multidisziplinär aufgestelltes Forscherteam koordiniert nun seine Forschungsanstrengungen, um diesen Pilz und die mit ihm einhergehende Produktion des Toxins in Lebensmittelen und Tierfutter zu verhindern. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
PHI-base ist eine im Web frei zugängliche Datenbank für Gene aus Pilzen, Oomoyceten und Bakterien, die für Pathogenität und Virulenz relevant sind. Es sind Pathogene berücksichtigt, die Tiere, Pflanzen und Pilze befallen. PHI-base ist daher eine wertvolle Ressource im Kontext der Entdeckung von Genen bei medizinisch und agronomisch relevanten Pathogenen als Ziele chemischer Interventionen. Alle Einträge in PHI-base basieren auf verläßlichen experimentellen Ergebnissen und werden durch kompetente Kuratoren geprüft. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Mit finanzieller Unterstützung der Wellcome Trust Functional Genomics Development Initiative strebt das Projekt GeneDB an, primär für drei Organismen kuratierte Datenbankressourcen zu entwickeln und zu unterhalten: Schizosaccharomyces pombe (vollständig sequenziert), sowie die Protozoen Leishmania major und Trypanosoma brucei (Sequenzierung noch abzuschließen). Zu den Zielen gehört, die Daten einzusammeln, zu speichern und zu pflegen, sie für die Integration in anlaufende Projekte im Bereich Functional genomics and proteomics zur Verfügung zu stellen, und eine einfach zu benutzende Schnittstelle zu bieten. Für die Zukunft wird in's Auge gefaßt, die übergreifend nutzbare Datenbankstruktur auch für Datensets zu anderen Organismen zu übernehmen, die am Sanger Institute Pathogen Sequencing Unit sequenziert wurden. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Die Webseite stellt als Online-Lehrbuch das begleitende Angebot zu dem Buch "Through the microscope" von Timothy Paustian und Gary Roberts da. Es behandelt alle Aspekte der Mikrobiologie in 26 verschiedenen Kapiteln. Frei verfügbar sind zunächst nur die Kapitel 1,2 und 15 - nach Registrierung ist jedoch das komplette Angebot zugänglich. ... [Redaktion vifabio]
