Die UniPROBE-Datenbank (Universal PBM Resource for Oligonucleotide Binding Evaluation) beherbergt Daten, die durch universelle Proteinbindungs-Microarray(PBM)-Technologie zu den in-vitro DANN-Bindungsspezifitäten von Proteinen generiert wurden. Diese erstmalige Herausgabe der UniPROBE-Datenbank bietet eine zentrale Ressource für die Zugänglichkeit von vergleichenden Daten zu den Präferenzen von Proteinen aller möglicher Sequenzvariationen (‚Worte“) von Länge k („k-mere“), wie auch „Position weight matrix“ (PWM) und graphische Sequenz-Logo-Repräsentationen der k-mer-Daten. Alles in allem enthält die Datenbank aktuell DNA-Bindungsdaten von 406 nicht-redundanten Proteinen aus einer diversen Sammlung von Organismen, einschließlich dem Prokaryoten Vibrio harveyi, dem eukaryotischen Malaria-Parasiten Plasmodium falciparum, dem parasitischen Apicomplexan Cryptosporidium parvum, der Hefe Saccharomyces cerevisiae, dem Wurm Caenorhabditis elegans, Maus und Mensch. Die Datenbank-Web-Tools (auf der rechten Seite) schließen eine text-basierende Suche, eine Funktion für den Zugang zu Motif-Ähnlichkeiten zwischen durch den Nutzer eingetragenen Daten und Datenbank-PWMs, und eine Funktion für die Lokalisierung von mutmaßlichen Bindungsstellen in den vom Nutzer eingegebenen Nukleotidsequenzen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
