T1DBase is a public website and database that supports the type 1 diabetes (T1D) research community. It is being created by a joint effort between the Institute for Systems Biology, Juvenile Diabetes Research Foundation/Wellcome Trust Diabetes and Inflammation Laboratory and the Juvenile Diabetes Research Foundation International. T1DBase collects information from public sources and from collaborating laboatories, integrates this information, and presents it in a form that is useful for T1D researchers. The current data scope includes annotated genomic sequences for suspected T1D susceptibility regions; microarray data; functional annotation of genes active in beta cells; and "global"datasets, generally from the literature, that are useful for systems biology studies. ... [Information of the supplier, modified]
Das Verbundvorhaben MediGRID zeigt am Beispiel biomedizinischer Forschung mit hochdimensionalen Daten und der Verknüpfung von vielfältigen, genotypischen und phänotypischen Daten die Anwendbarkeit und Relevanz von GRID-Diensten in der Medizin und in den Lebenswissenschaften. MediGRID ist ein Teilprojekt von D-GRiD, arbeitet mit im D-GRID-Integrationsprojekt (DGI) und tauscht sich intensiv mit den anderen GRID-Communites aus. ... [Information des Anbieters]
HuGE Literature Finder ist eine Suchmaschine für Literatur über genetische Zusammenhänge und zahlreiche weitere Aspekte von menschlichem Genom und Epidemiologie. Es kann gezielt nach Krankheiten, Umweltfaktoren, Genen, Autorennamen usw. gesucht werden; die Ergebnisse können auf verschiedene Weise gefiltert werden. Die gefundenen Artikellisten enthalten Weiterleitungen zu PubMed, um die dortigen Funktionalitäten einschließlich des Imports in Literaturverwaltungsprogramme nutzen zu können. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Das auf dieser Website vorgestellte Forschungsprojekt GUDMAP wurde vom NIDDK und dem NICHD erstellt, um die Stammzellenforschung und damit die Grundlagenforschung der Entwicklungsbiologie zu unterstützen. Grund dafür sind erkannte große Lücken bei den Grundlagen auf diesem Forschungsfeld und die damit unzureichenden Einsatzmöglichkeiten von Stammzellen in der Medizin. Im Vordergrund stehen hier die Erarbeitung von Strategien zum Einsatz der Stammzellen bei Organschäden oder auch dem Ersatz defekter Organe. Des Weiteren sollen Einsichten in die Entwicklung der Organe und damit auch diejenige von Organdefekten und -erkrankungen gewonnen werden, um letzteren eventuell vorbeugen oder besser entgegenwirken zu können. Das Ziel von GUDMAP ist deshalb die detaillierte Beschreibung der Verdauungsorgane und der Niere. Um dies zu erreichen sollen die folgenden drei Verfahren angewandt und weiterentwickelt werden: a) Hochdurchsatz-in situ-Hybridisierungsanalysen, um die Expressionsmuster von Genen, die in den oben genannten Organen exprimiert werden, zu untersuchen, b) hochauflösende Genexpressionsanalysen, um die Genexpression im Verlauf der Organentwicklung zu definieren, so Gemeinsamkeiten bei den Genexpressionsmustern erkennen zu können und schließlich auf Zusammenhänge zwischen Genexpression und Organfunktion schließen zu können und c) eine Datenbank zu erstellen, in der die gesammelten Daten der gesamten Forschungsgemeinschaft zur Verfügung gestellt werden können. Schließlich sollen auch Microarrayanalysen und die Zucht von Mäusestämmen mit genetischen Markern im Verlauf dieses Projekts zum Einsatz kommen, um das Ziel der Definition von molekularer und zellulärer Anatomie im Verlauf der Enticklung der Organe zu unterstützen. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Dr.VIS sammelt und lokalisiert mit humanen Krankheiten verknüpfte virale Integrationsstellen. Bis jetzt sind ca. 600 Stellen erhältlich, die 5 Virusorganismen und 11 menschliche Krankheiten abdecken. Integrationsstellen in Dr. VIS sind gegen Chromosomen-, Cytoband-, Gen- und Refseq-Positionen, so spezifisch wie möglich, lokalisiert worden. Viral-zelluläre Junction-Sequenzen wurden aus Papern und Nukleotid-Datenbanken extrahiert, und sind mit korrespondierenden Integrationsstellen verknüpft. Graphische Bilder, die die Verteilung von viralen Integrationsstellen zusammenfassen, sind mit Hilfe von Chromosomenkarten erzeugt worden. Es steht Ihnen frei sich umzusehen und Daten von Dr. VIS zu downloaden. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
WormBase ist ein internationals Konsortium aus Biologen und Computerwissenschaftlern, die sich zum Ziel gesetzt haben, die Wissenschafts-Community mit akkuraten, aktuellen und zugänglichen Informationen über die Genetik, das Genom und die Biologie von C. elegans und einigen verwandten Nematoden zu versorgen. [Information des Anbieters, übersetzt]
The cyclic AMP response element (CRE)-binding protein (CREB) family of activators (CREB1, CREM, ATF1) functions in diverse physiological processes, including the control of cellular metabolism, growth-factor-dependent cell survival, and developement an plasticity of neurons. A diverse range of signals, including cAMP, calcium, stress and mitogenic stimuli, can activate CREB and promote target gene expression. This database is dedicated to catogerize CREB target genes in a comprehensive and easy-to-search way. We have used a multi-layered approach to predict, validate and chracterize CREB target genes. For each gene, we try to provide the following information: 1. CREB binding sites on the promoters, 2. Promoter occupancy by CREB, 3. Gene activation by cAMP in tissues. The data are for humans, rats, and mice. ... [Information of the supplier, modified]
Interactive Fly stellt kostenlos umfassendes Bild- und Textmaterial zur Entwicklung von Drosophila melanogaster zur Verfügung. Dabei liegt der Schwerpunkt auf den beteiligten Genen und ihrer Interaktion. Die Einzelabfrage relevanter Gene liefert Informationen zu deren Locus, Klassifikation, Funktion, Mutation, Regulation, Evolution und wichtiger Referenzliteratur. Zusätzlich sind die Gene nach ihrer biochemischen Funktion und ihrer Beteiligung an Signalwegen zusammengefasst. Auf dieser Website, die 1996 veröffentlicht und zurzeit dreimal jährlich aktualisiert wird, sind außerdem die Morphogenese und die Organogenese der verschiedenen Entwicklungsstadien ausführlich beschrieben. ... [Redaktion vifabio]
FlyView ist eine Bilddatenbank zur Entwicklung und Genetik von Drosophila, die sich speziell mit den Expressionsmustern von Enhancer trap-Linien und klonierten Genen befasst. Unser Ziel ist es, Bilder auf dem Computerbildschirm vergleichen und so nach speziellen Mustern in unterschiedlichen Entwicklungsstadien suchen zu können. In FlyView gibt es drei Suchmöglichkeiten: Die Suche nach Mustern (über Stichwörter, wobei die Treffer als Photos mit einem Link zu den zugehörigen Linien angezeigt werden), die Suche nach Linien (über Stammnummer, Allel, Genotyp, Chromosom, Insertionsstelle, Lebensfähigkeit, Entwicklungsstadium oder Expressionsmuster; die Treffer werden aufgelistet und sind mit Vollbeschreibungen verlinkt (zu denen auch Photos, E-Mail-Bestelladressen und – im Fall der BDGP-Linien – Links zu FlyBase und/oder EoDf gehören)) und der Überblick (dahinter verbirgt sich eine aktuelle Liste aller Linien mit einer Verlinkung auf die zugehörigen Beschreibungen und Photos). Der Erfolg dieser Datenbank hängt ausschließlich von der Aktivität der Drosophila-Gemeinde ab. Alle Drosophila-Forscher sind eingeladen, durch die Übermittlung von Photos und Beschreibungen zu dieser Datenbank beizutragen. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Zu den Zielen des Drosophila Genome Center gehören die Vervollständigung der euchromatischen Genomsequenz von Drosophila melanogaster und die damit einhergehenden biologischen Sequenz-Annotationen. Zusätzlich zur Genom-Sequenzierung, bietet das BDGP 1) die Veränderung von Genen mittels P-Element vermittelter Mutagenese in einem für Metazoen bisher noch nie da gewesenen Maßstab 2) die Charakterisierung der Sequenz und der Expressionsmuster der cDNA 3) die Entwicklung von IT-Tools, die Versuchsabläufe unterstützen, Charakteristika von DNA-Sequenzen identifizieren und es uns erlauben, der Forschungsgemeinschaft aktuellste Informationen über die annotierte Sequenz zu liefern. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
