NONCODE is a database of all kinds of noncoding RNAs (except tRNAs and rRNAs). It is distinguished from other ncRNA databases by: 1. The data amount of NONCODE is big, and almost all traditional ncRNA classes are included. 2. All the sequences are confirmed by consulting the references manually, more than 80% data are from experiments. 3. We introduced a new classification system -- process function classification system, which based on the cellular process it takes part in. 4. NONCODE also provides an efficient search option, allowing recovery of sequence, related publications and other information. Now it contains 5,339 public sequences from 861 organisms covering all kingdoms of life, including vira and viroids. ... [Information of the supplier]
RNAi Database provides comprehensive access to publicly available RNAi phenotypic data from the worm Caenorhabditis elegans. RNAiDB provides raw data (in the form of images and movies), annotated phenotypes, graphical gene maps, analysis of potential off-target gene inhibition, and tools for searching and mining phenotypic data. ... [Information of the supplier, modified]
Die NCBI Entrez Genome Project- Datenbank ist vorgesehen als eine durchsuchbare Sammlung vollständiger (und unvollständiger) Sequenzierungen, Kartierungen und Dokumentationen zellulärer Organismen. Die Datenbank ist in organismen-spezifische Bereiche unterteilt, die als Portal funktionieren, von dem aus alle Projekte, diesen Organismus betreffend, aufgerufen werden können. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Genes to Cognition (G2C) ist ein internationales neurowissenschaftliches Forschungsprogramm mit dem Ziel, grundlegende biologische Prinzipien zu entdecken und Einsicht in Gehirnkrankheiten zu ermöglichen. Während die Datenbank eher für Experten von Interesse sein wird, ist der Educational-Teil für Einsteiger in das Thema der Gehirnkrankheiten wirklich empfehlenswert. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
Genatlas ist eine Datenbank mit relevanten Informationen zu gene mapping und Erbkrankheiten. Es gibt eine Phenotypdatenbank, eine Genotypdatenbank und eine Datenbank für Literatur. Die Datenbank wurde 1986 von Jean Frézal aufgebaut und bildet seither eine wichtige Forschungsgrundlage für Forscher auf dem Gebiet der Genetik. Es gibt drei verschiedene Suchmodi: a) Volltextsuche, b) Anfrage mittels Symbolname oder id OMIM und c) Suchmodus anhand mehrerer Kriterien. Die verfügbaren Daten werden täglich aktualisiert. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
HaploReg ist ein Hilfsmittel für die Erkundung von Vermerken zum nicht-codierenden Genom in Varianten von haploiden Bereichen, wie z.B. mögliche regulatorische SNPs auf krankheits-assoziierten Loci. Unter Verwendung von LD-Information des 1000-Genome-Projekts können verknüfte SNPs und kleine INDELs gemeinsam mit ihrem vorhergesagtem Chromatinstatus in 9 Zelltypen, mit ihrem Erhaltungszustand innerhalb der Säugetiere und mit ihren Effekten auf regulatorische Motive visualisiert werden. HaploReg wurde für Forscher erstellt, welche mechanistische Hypothesen zu Auswirkungen von nicht-codierten Varianten auf klinische Phänotypen und normale Varianten entwickeln. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Diese Webseite ist eine Datenbank für Bio-Projekte. Ein Bio-Projekt (BioProject) ist eine Sammlung von biologischen Daten, welche sich auf eine einzige Initative beziehen, ausgehend von einer einzigen Organisation oder von einer Arbeitsgemeinschaft. Ein Bio-Projekt-Eintrag bietet Nutzern einen Platz, um alle Links zu den unterschiedlichsten Datentypen, welche für dieses Projekt generiert wurden, zu finden. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Die M-Phase, auch Zellteilung genannt, ist die wichtigste und fundamentalste Angelegenheit des eukaryotischen Zellzyklus. Nach der Replikation der Chromosomen während der S-Phase, werden die Schwester-Chromatiden getrennt und in die zwei Tochterzellen gleich aufgeteilt. Jede Tochterzelle erhält die durchschnittlichen und nötigen intrazellulären Komponenten und Organellen der Mutterzelle. Generell besteht die Zellteilung aus 6 Stufen, einschließlich Prophase, Prometaphase, Metaphase, Anaphase, Telophase und Cytokinese. Und die ersten 5 Schritte konstituieren die Mitose. Während der Mitose organisieren zahlreiche Proteine zu Super-Komplexen. Auch wenn bekannt ist, dass viele Proteine im Centromer, in den Kinetochoren und/oder den Intermediärkörperchen lokalisiert sind, gibt es keine integrierte Ressource auf diesem Gebiet. Deshalb haben wir hier alle solcher Proteine von 2 Pilzarten (S. cerevisiae und S. pombe) und 5 Tieren, einschließlich C. elegans, D. melanogaster, X. laevis, M. musculus und H. sapiens, gesammelt. Aus der verwandten Literatur von PubMed, wurde eine Vielzahl von Proteinen, die zumindest in einer der subzellulären Orte von Kinetochoren, dem Centrosom und den Intermediärkörperchen zu finden sind, manuell kuratiert. Um die Qualität der Daten, basierend auf „Sehen ist Glauben“, wurden diese Proteine eindeutig unter dem Fluoreszenzmikroskop untersucht. Danach wurde eine integrierte und suchbare Datenbank MiCroKit - Midbody, Centrosome and Kinetochore erstellt. Die MiCroKit-Datenbank ist die erste einheitliche Ressource um einen Großteil der identifizierten Komponenten und verwandten wissenschaftlichen Informationen zu Intermediärkörperchen, Centromer und Kinetochoren bereit zu stellen. Die Version 1.0 der MiCroKit-Datenbank wurde im November 2005 erstellt, und enthält 1,065 einzigartige Proteine. Die MiCroKit Version 2.0 wurde im Juni 2006, auf 1,120 Einträgen erweitert. Die aktuelle 3. Version der Datenbank wurde im Juli 2009 aktualisiert, und enthält 1,489 einzigartige Proteineinträge. ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
SINEBase ist eine Datenbank von Short interspersed elements und ein Toolset für deren Identifizierung und Analyse. Short interspersed elements (SINEs) sind sich wiederholende DNA-Sequenzen, die in die Genome von Eukaryoten eindringen. Sie können in einigen Arten mehr als 10% des Genoms einnehmen, in anderen aber gänzlich fehlen. Obwohl diese genomischen Parasiten auch schädlich für die Zelle sein können, stellt eine langfristige Verweildauer der SINEs im Genom auch einen wertvollen Faktor der genetischen Variation dar, indem sie regulatorische Elemente zur Expression eines Gens, alternative Spleißstellen, Polyadenylierungssignale und auch funktionelle RNA-Gene bereitstellen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Agricola ist eine bibliographische Datenbank der agrarwissenschaftlichen Literatur seit 1970, mit einigen Nachweisen auch aus früheren Jahrhunderten. Auch Nachbargebiete wie Botanik, Forstwissenschaften und Geographie sind teilweise berücksichtigt. [Redaktion vifabio]
