Diese Seite erlaubt den Vergleich einer Antikörper-Sequenz mit der Kabat-Datenbank. Alle ungewöhnlichen Aminosäuren, die in weniger als 1% der Sequenzen in der Datenbank vorkommen, werden dem Benutzer angezeigt; dadurch können Klonierungsartefakte und Sequenzierfehler erkannt werden. Die Kabat-Datenbank umfaßt im Moment (März 2007) 6014 leichte Ketten und 7895 schwere Ketten. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
CATH is a hierarchical classification of protein domain structures, which clusters proteins at four major levels, Class(C), Architecture(A), Topology(T) and Homologous superfamily (H).Class, derived from secondary structure content, is assigned for more than 90% of protein structures automatically. Architecture, which describes the gross orientation of secondary structures, independent of connectivities, is currently assigned manually. The topology level clusters structures into fold groups according to their topological connections and numbers of secondary structures. The homologous superfamilies cluster proteins with highly similar structures and functions. The assignments of structures to fold groups and homologous superfamilies are made by sequence and structure comparisons. The boundaries and assignments for each protein domain are determined using a combination of automated and manual procedures. These include computational techniques, empirical and statistical evidence, literature review and expert analysis. ... [Information of the supplier]
Der "Molecular Genetics Explorer" ist eine BioQUEST Simulationssoftware zum Untersuchen biologischer Phänomene, die die Bereiche Genetik, Biochemie und Molekularbiologie umfasst. Sie wurde entwickelt, um Studenten die Beziehungen zwischen diesen drei Schlüsseldisziplinen der modernen molekularen Genetik zu verdeutlichen, welche auf dem Botsteinschen Dreieck beruhen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
BioMagResBank (BMRB) is the publicly-accessible depository for NMR results from peptides, proteins, and nucleic acids recognized by the International Society of Magnetic Resonance and by the IUPAC-IUBMB-IUPAB Inter-Union Task Group on the Standardization of Data Bases of Protein and Nucleic Acid Structures Determined by NMR Spectroscopy. In addition, BMRB provides reference information and maintains a collection of NMR pulse sequences and computer software for biomolecular NMR. Access to data in BMRB is free directly from its web site (URL http://www.bmrb.wisc.edu) and ftp site (ftp.bmrb.wisc.edu) and will remain so as public funding permits. The concept of a biomolecular NMR data bank was developed under a five-year research grant awarded to the University of Wisconsin-Madison from the National Library of Medicine, National Institutes of Health. ... [Information of the supplier]
Dieser Dienst im Internet möchte es dem Endnutzer erleichtern, Bilder und Videos von Proteinstrukturen zu erzeugen, indem mittels der Software "Dino" die am häufigsten gebrauchten Tools aus dem Bereich der molekularen Grafikerstellung verwendet werden. "High Definition (HD)" - Bilder und Videos werden mithilfe der Megapov Engine, die auf dem "Persistance of Vision" Raytracer basiert, generiert (POV-Ray engine). Die Rendering Engine ist mit externen Programmen wie Stride (secondary structure determination) oder msms (molecular surface calculation) gekoppelt. Somit kann dieser Dienst statische Bilder ebenso erzeugen wie Videosequenzen, die z.B. das makromolekulare "Andocken", die molekulare Dynamik, die NMR Modelldiversität oder Proteinbewegungen veranschaulichen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Unser Ziel: Die Proteinfaltung, die Proteinaggregation und die damit zusammenhängende Krankheiten zu verstehen. Proteine sind biologische Arbeitspferde – es sind „Nanomaschinen“. Bevor Proteine ihre biochemische Arbeit aufnehmen, bauen sie sich bemerkenswert selbst zusammen oder „falten“ sich. Obwohl der Prozess der Proteinfaltung entscheidend ist und die Grundlage der ganzen Biologie darstellt, ist er für uns noch immer ein Geheimnis. Es ist daher wohl nicht überraschend, dass es schwere Auswirkungen hat, wenn sich Proteine nicht richtig falten (im englischen „misfold“). So entstehen viele bekannte Krankheiten, wie Alzheimer, BSE, CJD (Creutzfeldt-Jakob-Krankheit), ALS (Amyotrophe Lateralsklerose) oder Parkinson. Was macht Folding@Home? Folding@Home ist ein Projekt für verteiltes Rechnen (Distributed Computing) - Menschen aus der ganzen Welt scharen sich zusammen und führen unsere Software aus. Auf diese Weise entsteht einer der größten Supercomputer der Welt. Unsere Algorithmen sind so entworfen, dass wir für jeden Computer, der an dem Projekt teilnimmt, eine angemessene Zunahme der Simulationsgeschwindigkeit erhalten. Die einzigartige Kombination unserer neuen Methoden und des verteilten Rechnens ermöglicht uns Probleme zu bearbeiten, welche zigtausendmal aufwändiger sind als zuvor gelöste Probleme. Wir hatten bereits einige Erfolge. Mehr darüber lesen können Sie auf unserer Wissenschaftsseite, im Ergebnisbereich oder besuchen Sie unsere Presse- und Veröffentlichungs-Webseiten. ... [Information des Anbieters, verändert]
Das erste Ziel von computerunterstützter molekularer Biologie, wie auch von Molekularbiologie selbst, ist die Bedeutung der Genom-Information zu verstehen und wie diese Information ausgedrückt ist. Unser Interesse gilt den Problemen der Voraussage der biologischen Funktion von Genen und Genprodukten aus ihrer primären Sequenz und Struktur. Weiterhin gilt unser Interesse der Voraussage der Struktur von Proteinen und DNS aus ihrer Sequenz und dem Verständnis wie und wann Gene abgelesen werden. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Das HUSAR Bioinformatics Lab am Deutschen Krebsforschungszentrum bietet topaktuellen Bioinformatik-Support und Training für den Wissenschaftler der (Post-)Genomära. Dies beinhaltet die Heidelberg Unix Sequence Analysis Resources (HUSAR), eine große Sammlung von essentiellen Tools für die Sequenzanalyse. [Information des Anbieters, übersetzt]
Die Homepage von Ehud Shapiro, einem der führenden Wissenschaftler im Bereich Nanotechnologie und molekulare Automaten, gibt Einblicke in sein Forschungsgebiet und erlaubt Zugriff auf seine zahlreichen Vorträge (Powerpoint, PDF). Vervollständigt wird die Seite durch Links zu Publikationen und publizierten Presseartikeln. [Redaktion vifabio]
Die iGEM Registry ist eine wachsende Sammlung von genetischen Bauteilen, die vermischt und zusammengesetzt werden können, um synthetische biologische Objekte und Systeme zu bauen. [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]