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Datenbank-Führer

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Der Allen Brain Atlas (ABA) stellt eine interaktive und genomweite Bilddatenbank der Genexpressionsmuster im Mäusegehirn dar. Auf der Webseite sind eine Kombination von RNA In-Situ Hybridisierungsdaten, ein ausführlicher Referenzatlas und ein IT-gestütztes Analysewerkzeug integriert worden, um einen ... [Information des Anbieters, übersetzt]
www.brain-map.org/
In Bakterien sind kleine (~30-500 nt) nicht-kodierende RNAs (sRNAs ) die häufigste Klasse von post- transkriptionellen Regulatoren, die in vielfältigen Prozessen einschließlich dem Quorum Sensing, der Stress-Reaktion, der Virulenz und dem Kohlenstoff-Metabolismus beteiligt sind. Basierend auf den ... [Information des Anbieters, übersetzt]
kwanlab.bio.cuhk.edu.hk/BSRD/
ChIPBase ist eine eine integrierte Ressource und eine Plattform für die Dekodierung von Transkriptionsfaktorbindungsstellenkarten, Expressionsprofile und transkriptionale Regulation der langen nicht-kodierenden RNAs (lncRNAs, lincRNAs), microRNAs, anderer ncRNAs (snoRNAs, tRNAs, snRNAs, etc.) und ... [Information des Anbieters, übersetzt]
deepbase.sysu.edu.cn/chipbase/
Die Webseite der Datenbank für vergleichbare ribosomale Komplexe (DARC – Database für Aligned Ribosomal Complexes) ist ein Hilfsmittel für den direkten Vergleich der Strukturen von verfügbaren ribosomalen Komplexen. Die Webseite bietet eine Sammlung von Dateien, die in der RCSB Proteindatenbank und der ... [Information des Anbieters, übersetzt]
darcsite.genzentrum.lmu.de/
Die virale siRNA Datenbank (VIRsiRNAdb) ist eine strukturelle Sammlung von experimentell bestätigten siRNAs, veröffentlicht in der wissenschaftlichen Literatur, welche auf diverse Gene von humanmedizinisch wichtigen Viren abzielen. Die Pflegebemühungen konzentrieren sich bisher hauptsächlich auf bekannte ... [Information des Anbieters, übersetzt]
crdd.osdd.net/servers/virsirnadb/
LncBase stellt Informationen für vorhergesagte und experimentell verifizierte miRNA - lncRNA Wechselwirkungen zur Verfügung. Die Datenbank besteht aus zwei getrennten Modulen. Das experimentelle Modul enthält detaillierte Informationen über mehr als 5.000 Wechselwirkungen zwischen 2.958 lncRNAs und 120 ... [Information des Anbieters, übersetzt]
diana.imis.athena-innovation.gr/DianaTools/index.php?r=lncBase/index
In Tieren regulieren RNA-Bindungsproteine (RBP) und mikroRNA (miRNA) die Expression von förmlich allen Genen post-transkriptional durch die Bindung von RNA. Aktuelle Fortschritte in experimentellen und kombinatorischen Methoden ermöglichen das transkriptom-weite Abbilden von diesen Interaktionen. Es wird ... [Sonstige Quelle laut Angabe]
dorina.mdc-berlin.de/rbp_browser/dorina.html
Die "greengenes"-Webapplication bietet einen Zugang zu aktuellen und umfassenden 16S rRNA-Gensequenzalignments, welche durch Browsen, Analysieren und Downloaden näher betrachtet werden können. Die Daten, die greengenes präsentiert, können Wissenschaftlern bei der Wahl phylogenetisch-spezifischer Sonden, ... [Information des Anbieters, übersetzt]
greengenes.lbl.gov/
JASPAR ist eine Datensammlung zu Transkriptionsfaktoren und ihren DNA-Bindungen, modelliert in Form von Matrizes. Diese können in Position Weight Matrices (PWMs or PSSMs) konvertiert werden, wie sie für das Scannen von Genomsequenzen verwendet werden. JASPAR ist die einzige Datenbank zu diesem Themengebi... [Information des Anbieters, übersetzt]
jaspar.genereg.net/
Die miRBase Sequenz Datenbank ist ein durchsuchbare Datenbank mit publizierten miRNA Sequenzen und Annotationen. Die Daten hier wurden vormals von miRNA Registry bereitgestellt. Jeder Eintrag in der miRBase Sequenz Datenbank repräsentiert ein vorausgesagtes "Haarnadel" Teilstück eines miRNA Transkripts ... [Information des Anbieters, übersetzt]
microrna.sanger.ac.uk/sequences/
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