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Datenbank-Führer
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Der Nuclear Receptor Signaling Atlas (NURSA) wurde erstellt, um ein umfassendes Verständnis der Struktur und Funktion von Nukleärrezeptoren sowie ihrer Rolle in Krankheitsprozessen zu entwickeln. Während der Atlas als funktioneller Atlas der sog. "Orphan Nuclear Receptors" begonnen wurde, um die Rolle, ... [Information des Anbieters, übersetzt und verändert]
www.nursa.org/
Das Gene Ontology (GO) Projekt ist der gemeinschaftliche Versuch, das Bedürfnis nach einer einheitlichen Beschreibung von Genprodukten in verschiedenen Datenbanken zu erfüllen. Die GO-Mitarbeiter entwickeln dazu drei strukturierte und kontrollierte Begriffswelten (Ontologien), die die Genprodukte auf ... [Information des Anbieters, übersetzt]
www.geneontology.org/
APPRIS ist ein System, das eine Reihe von Rechenverfahren anwendet, um einen Betrag der Annotierungen des menschlichen Genoms bereitzustellen. APPRIS wählt desweiteren einen der CDS für jedes Gen als Hauptisoform. APPRIS definiert die Hauptvariante durch Kombination von Proteinstrukturinformation, ... [Information des Anbieters, übersetzt]
appris.bioinfo.cnio.es/
The plant snoRNA Database and web-site brings together information from three independent computer-assisted searches of the Arabidopsis genome for box C/D snoRNA genes and from studies of ncRNAs. To date, the Arabidopsis box C/D snoRNAs have been used to identify approximately 250 genes from different ... [Information of the supplier]
bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home
The Ribosomal Database Project (RDP) provides ribosome related data services to the scientific community, including online data analysis, rRNA derived phylogenetic trees, and aligned and annotated rRNA sequences. [Information of the supplier]
rdp.cme.msu.edu/
snoRNA-LBME-db includes profiles of more than 350 human snoRNAs, with descriptions of the molecule and data on sequence, size and target. Data is accessible for searching and browsing. [Editorial staff vifabio]
www-snorna.biotoul.fr/
Die miRBase Sequenz Datenbank ist ein durchsuchbare Datenbank mit publizierten miRNA Sequenzen und Annotationen. Die Daten hier wurden vormals von miRNA Registry bereitgestellt. Jeder Eintrag in der miRBase Sequenz Datenbank repräsentiert ein vorausgesagtes "Haarnadel" Teilstück eines miRNA Transkripts ... [Information des Anbieters, übersetzt]
microrna.sanger.ac.uk/sequences/
Der Allen Brain Atlas (ABA) stellt eine interaktive und genomweite Bilddatenbank der Genexpressionsmuster im Mäusegehirn dar. Auf der Webseite sind eine Kombination von RNA In-Situ Hybridisierungsdaten, ein ausführlicher Referenzatlas und ein IT-gestütztes Analysewerkzeug integriert worden, um einen ... [Information des Anbieters, übersetzt]
www.brain-map.org/
JASPAR ist eine Datensammlung zu Transkriptionsfaktoren und ihren DNA-Bindungen, modelliert in Form von Matrizes. Diese können in Position Weight Matrices (PWMs or PSSMs) konvertiert werden, wie sie für das Scannen von Genomsequenzen verwendet werden. JASPAR ist die einzige Datenbank zu diesem Themengebi... [Information des Anbieters, übersetzt]
jaspar.genereg.net/
SILVA ist ein Projekt zur Schaffung einer umfassenden Datenbank von rRNA-Sequenzdaten aus allen drei Domänen (Bacteria, Archaea und Eukarya), die für wissenschaftliche Zwecke zur freien Verfügung steht. SILVA basiert auf dem Softwaresystem ARB. Zurzeit existiert eine als "Beta" bezeichnete Version neben ... [Redaktion vifabio]
www.arb-silva.de/
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