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Datenbank-Führer

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The Ribosomal Database Project (RDP) provides ribosome related data services to the scientific community, including online data analysis, rRNA derived phylogenetic trees, and aligned and annotated rRNA sequences. [Information of the supplier]
rdp.cme.msu.edu/
snoRNA-LBME-db includes profiles of more than 350 human snoRNAs, with descriptions of the molecule and data on sequence, size and target. Data is accessible for searching and browsing. [Editorial staff vifabio]
www-snorna.biotoul.fr/
Die miRBase Sequenz Datenbank ist ein durchsuchbare Datenbank mit publizierten miRNA Sequenzen und Annotationen. Die Daten hier wurden vormals von miRNA Registry bereitgestellt. Jeder Eintrag in der miRBase Sequenz Datenbank repräsentiert ein vorausgesagtes "Haarnadel" Teilstück eines miRNA Transkripts ... [Information des Anbieters, übersetzt]
microrna.sanger.ac.uk/sequences/
Der Allen Brain Atlas (ABA) stellt eine interaktive und genomweite Bilddatenbank der Genexpressionsmuster im Mäusegehirn dar. Auf der Webseite sind eine Kombination von RNA In-Situ Hybridisierungsdaten, ein ausführlicher Referenzatlas und ein IT-gestütztes Analysewerkzeug integriert worden, um einen ... [Information des Anbieters, übersetzt]
www.brain-map.org/
JASPAR ist eine Datensammlung zu Transkriptionsfaktoren und ihren DNA-Bindungen, modelliert in Form von Matrizes. Diese können in Position Weight Matrices (PWMs or PSSMs) konvertiert werden, wie sie für das Scannen von Genomsequenzen verwendet werden. JASPAR ist die einzige Datenbank zu diesem Themengebi... [Information des Anbieters, übersetzt]
jaspar.genereg.net/
SILVA ist ein Projekt zur Schaffung einer umfassenden Datenbank von rRNA-Sequenzdaten aus allen drei Domänen (Bacteria, Archaea und Eukarya), die für wissenschaftliche Zwecke zur freien Verfügung steht. SILVA basiert auf dem Softwaresystem ARB. Zurzeit existiert eine als "Beta" bezeichnete Version neben ... [Redaktion vifabio]
www.arb-silva.de/
Die Webseite der Datenbank für vergleichbare ribosomale Komplexe (DARC – Database für Aligned Ribosomal Complexes) ist ein Hilfsmittel für den direkten Vergleich der Strukturen von verfügbaren ribosomalen Komplexen. Die Webseite bietet eine Sammlung von Dateien, die in der RCSB Proteindatenbank und der ... [Information des Anbieters, übersetzt]
darcsite.genzentrum.lmu.de/
Diese Datenbank möchte für jeden hilfreich sein, der die Rolle von microRNAs (miRNAs) in der Wachstumsphase von Pflanzen, in der Organbildung und bei der Reaktion auf verschiedene biotische und abiotische Streßreize erforschen will. Um die Datenbank zu erkunden, müssen Sie einfach auf „Browse Atlas“ ... [Information des Anbieters, übersetzt]
comgen.pl/mirex/
miRNEST ist eine umfangreiche Sammlung von tierischen, pflanzlichen und viralen microRNA-Daten. Die Datenbank bietet Ihnen 9980 miRNA-Kandidaten von 420 Tier- und Pflanzenarten, die in Expressed Sequence Tags vorhergesagt werden, vorhergesagte Targets für Pflanzenkandidaten, RNA-Seq die Kandidaten von 29 ... [Information des Anbieters, übersetzt]
lemur.amu.edu.pl/share/php/mirnest/
In Tieren regulieren RNA-Bindungsproteine (RBP) und mikroRNA (miRNA) die Expression von förmlich allen Genen post-transkriptional durch die Bindung von RNA. Aktuelle Fortschritte in experimentellen und kombinatorischen Methoden ermöglichen das transkriptom-weite Abbilden von diesen Interaktionen. Es wird ... [Sonstige Quelle laut Angabe]
dorina.mdc-berlin.de/rbp_browser/dorina.html
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