Gramene ist eine kuratierte Open Source-Datenbasis für die vergleichende Genomanalyse bei Gräsern. Unser Ziel ist die Unterstützung von Untersuchungen zu interspezifischen Homologie-Beziehungen. Dabei wird auf Daten aus öffentlichen Projekten zurückgegriffen, die sich mit Genom- und EST-Sequenzierung, mit Analyse von Proteinstrukturen und -funktionen, mit genetischem Mapping, mit der Interpretation von biochemischen Stoffwechselwegen, mit der Lokalisierung von Genen und von QTL sowie mit phänotypischen Merkmalen und Mutationen befassen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Panzea ist der bioinformatische Zweig des Projekts, welches die genetische Architektur von Mais und dessen Wildformen (NSF 0820619) erforscht. Das Projekt wird durch die National Science Foundation gefördert. Das Projekt beschreibt die genetische Architektur von komplexen Eigenschaften von Mais bzw. Zea. Wir werden Gene identifizieren, die für die Domestikation wichtige Eigenschaften und drei agronomische Schlüsseleigenschaften kontrollieren: Blutezeit, Pflanzenhöhe und Kornqualität. Wir werden die allelische Reihenfolge dieser Gene charakterisieren, ihre epistatischen und umweltlichen Interaktionen untersuchen und einen Schritt in Richtung dem letztendlichen Ziel der Vorhersage des Phänotyps aus dem Genotyp machen. Die genetischen, Keimgewebs- und bioinformatischen Ressourcen, die innerhalb des Projekts entstanden sind, warden Mais-Forschern weltweit helfen die genetische Basis jeder beliebigen Eigenschaft zu entdecken. Die Panzea-Webseite bietet einen Zugang zur Projekt-Datenbank und zum Bioinformatik-Modul. Die Panzea-Datenbank enthält genotypische und phänotypische Daten und genetische Marker-Informationen, die innerhalb des Projekts hergestellt wurden. Das Design der Datenbank basiert auf „Genomic Diversity and Phenotype Data Model“ (GDPDM). Das Datenbankschema und eine Excel-Datei mit Tabelle und Feldbeschreibungen sind auf dieser Webseite erhältlich. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Das Rice Annotation Project (RAP) wurde nach Beendigung der Sequenzierung des Reis-Genoms 2004 mit dem Ziel entworfen, der wissenschaftlichen Gesellschaft eine akkurate und zeitnah erläuterte Reis-Genom-Sequenz zu liefern. Eine der Hauptaufgaben von RAP ist es, erläuternde Meetings nach jamboree-style auf einer geregelten Basis zu veranstalten, um die manuelle Pflege aller Genstrukturen und -funktionen zu erleichtern. Ein weiteres Ziel ist es, die umfassende Analyse der Sequenz basierend auf den Ergebnissen der Annotation und die Konstruktion einer öffentlichen Datenbank zu erleichtern. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
