Die Human Metabolome Database (HMDB) ist eine frei verfügbare elektronische Datenbank für Detailinformationen zu niedermolekularen Metaboliten, die im menschlichen Körper vorkommen. Die beabsichtigten Verwendungsbereiche liegen bei Metabolomics, Klinischer Chemie, Biomarker-Identifizierung und in der Ausbildung. Die Datenbankstruktur ist darauf angelegt, drei Arten von Daten zu speichern bzw. zu verlinken: 1) chemische Daten, 2) klinische Daten und 3) molekularbiologische/biochemische Daten. Zur Zeit enthält die Datenbank fast 2500 Einträge zu Metaboliten; sowohl wasserlösliche als auch fettlösliche Metabolite, und sowohl in größerer Menge auftretende (> 1 uM) als auch seltenere Metabolite (< 1 nM) werden berücksichtigt. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
MMMDB 1.2 ist eine frei erhältliche metabolische Datenbank, die eine Sammlung von in verschiedenen Geweben einzelner Mäuse gemessenen Metaboliten enthält. Die Datensätze wurden unter Benutzung eines einzigen Instruments gesammelt, und es fließen keine Informationen aus externen Literaturquellen ein. Diese Tatsache ist für das Erfassen eines ganzheitlichen Überblicks großer metabolischer Stoffwechselwege von besonderer Bedeutung. Momentan werden Daten von folgenden Geweben in der Datenbank bereitgestellt: Großhirn, Kleinhirn, Thymus, Milz, Lunge, Leber, Niere, Herz, Pankreas, Hoden und Plasma. Nicht-gerichtete Analysen wurden durch Kapillarelektrophorese-Laufzeit-Massenspektroskopie (CE-TOFMS) durchgeführt, deshalb wurden sowohl identifizierte Metabolite als auch unbekannte Peaks (ohne passenden Standard) zur vorliegenden Datenbank hinzugefügt. Es werden nicht nur quantifizierte Konzentrationen, sondern auch rohe Daten, wie Elektropherogramme, Massen-Spektroskopie-Ergebnisse und Kommentare (wie Isotop und Fragment) für die Nutzer der Datenbank bereitgestellt. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Sequencing of the human genome has opened the way and provided the impetus for building a comprehensive picture of a mammalian cell. Significant efforts are underway in the fields of genomics and proteomics to identify all genes and proteins in a given organism. The goal is a complete map of the genes, gene products and their interaction networks in a functioning cell. The next step in establishing a comprehensive picture of a cell will be to tie the cell's metabolome into the rapidly developing genomic and proteomic maps. A cell's metabolome, however, is such an enormous and complex entity that characterizing it can only be approached in sections. This consortium is now proposing to focus on the lipid section of the metabolome by developing an integrated metabolomic system capable of characterizing the global changes in lipid metabolites ("lipidomics"). Our consortium has developed a Lipid Metabolites and Pathways Strategy, termed LIPID MAPS, that applies a global integrated approach to the study of lipidomics. ... [Information of the supplier]