GermOnline is a cross-species community annotation knowledgebase that provides microarray data relevant for the mitotic and meiotic cell cycle as well as gametogenesis. Importantly, GermOnline also integrates knowledge about genes important for sexual reproduction that is contributed and updated by members of the scientific community in collaboration with professional curators. ... [Information of the supplier]
GrainGenes ist eine Sammlung von Diensten für Forschergruppen zu Triticeae und Avena; die Ressource enthält Datenbanken, Dokumente, Werkzeuge, Rohdaten, Webseiten, Ankündigungen und Angebote zu Wartung und Support. [Information des Anbieters, übersetzt]
Based on the mapping of the human genome and the development of information databases, a broad description of genes transcribed in blood cells is now known. Hembase was developed to provide worldwide access to those genetic-based studies performed by scientists in the Molecular Biology and Genetics Section, Molecular Medicine Branch, Division of Intramural Research, National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases (NIDDK). This project represents the shared goal of several individuals and groups (credits) interested in disseminating genomic information on the World Wide Web. ... [Information of the supplier]
HEXEvent ist eine freie Datenbank, die eine Liste der menschlichen internen Exons bereitstellt und über alle bekannten Spleiß-Ereignisse berichtet, basierend auf EST-Informationen aus dem UCSC Genome Browser. Diese Liste kann durch den Benutzer entweder auf nur eine spezifische Region im Genom (durch Angabe des Chromosoms, des Strangs und der Start- und Endposition), auf ein ganzes Chromosom oder eine Gruppe von Genen begrenzt werden. Weiterhin können Exons nach ihrem Spleiß-Typ (konstitutive Exons, Kassetten-Exons und Exons mit einer oder mehreren alternativen 3'-und / oder 5'-Spleißstellen) gefiltert werden. Um eine benutzerdefinierte Gruppe von Exons zu extrahieren, können die Benutzer spezifische Definitionen von Exon-Arten festlegen. Der Benutzer muss angeben in welcher Fraktion von ESTs ein Exon sein darf, um alternativ gespleißt und noch als konstitutiv bezeichnet zu werden. Darüber hinaus kann der Benutzer die Menge der angeforderten Kassetten- Exons durch ein bestimmtes oberes Level beschränken. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
The HIV databases contain data on HIV genetic sequences, immunological epitopes, drug resistance-associated mutations, and vaccine trials. The website also gives access to a large number of tools that can be used to analyze these data. This project is funded by the Division of AIDS of the National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), a part of the National Institutes of Health (NIH). ... [Information of the supplier]
Für jedes bekannte menschliche Gen erkennen wir einen Gen-Namen und ein Symbol (knappe Abkürzung) an. Alle anerkannten Symbole sind in der HGNC-Datenbank gespeichert. Jedes Symbol ist einmalig und wir stellen sicher, dass jedes Gen nur ein einziges anerkanntes Gen-Symbol erhält. Eineindeutige Symbole für alle Gene sind einerseits eine Voraussetzung dafür, dass wir uns über die Gene verständigen können; andererseits erleichtern sie erheblich das elektronische Daten-Retrieval in Publikationen. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Das Ziel der HOM-Datenbamk ist es, der Forschergemeinschaft verständliche Information zum Thema der ca. 600 Prokaryonten, deren Lebensraum die menschliche Mundhöle ist, zugänglich zu machen. Die Mehrzahl der Arten werden weder in einem Labor kultiviert, noch wurden sie benannt, und sie werden lediglich auf Grund ihrer 16S rRNA-Sequenzen identifiziert. Die HOMD arbeitet mit einem provisorischen Namensgebungsschema, um die bislang unbenannten Arten einheitlich zu identifizieren und Stammkulturen, Klone und Probendaten aus einem beliebigen Labor direkt und unverwechslebar mit einem Namen verbinden zu können. Die HOMD verbindet Sequenzdaten mit phänotypischen, phylogenetischen, klinischen und bibliografischen Informationen. Genomsequenzen von Bakterien, deren Lebensraum vollständig oder auch nur teilweise in der menschlichen Mundhöle liegt, und die folglich auf dem Interessengebiet dieses Forschungsvorhabens und das des Human Microbiome Project liegt, werden nach ihrer Veröffentlichung schnellstmöglich in die HOMD aufgenommen. Die HOMD bietet einfach zu bedienende Werkzeuge, um die Genome der öffentlich zugänglichen Bakterien zu betrachten. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
L1Base ist eine Datenbank, die sich mutmaßlich aktiven LINE 1-Elementen verschrieben hat, welche in Human- und Nagergenomen angesiedelt sind: a) Interaktion in zwei ORFs, full length L1s (FLI-L1s) und b) L1s mit Interaktion an ORF2, aber zerstörten ORF1 (ORF2-L1s). Zusätzlich sind aufgrund ihres regulatorischen Potentials auch die Full length (>6000bp)-nichtinteragierenden L1s (FLI-L1s) in der Datenbank enthalten. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
“Multi-purpose Automated Genome Project Investigation Environment” (MAGPIE, http://magpie.ucalgary.ca/) ist ein Softwarepacket für die automatisierte Verwaltung und Präsentation von DNA- und Proteinsequenzen. MAGPIE filtert die Ergebnisse verschiedener Datenbanksuchergebnisse auf jede Sequenz (z.B. exprimierte Sequenz-Taqs, ESTs) oder Untersequenzen (z.B. offenes Leseraster, ORFs, in bakterieller genomischer DNA), und zeigt sie auf einer Zusammenfassungsseite, die Interpretationen der biologischen Rolle von Genen und Origins ermöglicht, an. ... [Information des Anbieters, übersetzt]
Metazome is a database and graphical user interface enabling comparative genomic studies within the Metazoa. As of version 1.1, the database houses eleven sequenced animal genomes and is constantly growing as new genomes become available. Each gene has been annotated with PFAM, KOG, and PANTHER assignments, and publicly available annotations from RefSeq, SwissProt, Ensembl, and JGI are hyper-linked and searchable. For comparative studies, various clustering methods have been applied to construct orthologous groups of genes that represent the modern descendents of ancestral gene sets at key phylogenetic nodes, including the ancestral tetrapod and vertebrate. These clusterings allow easy access to clade specific orthology/paralogy relationships as well as clade specific genes and gene expansions. Position specific profiles will be made available shortly and gene phylogenetic trees are available now for each cluster to enable deeper comparative studies. ... [Information of the supplier]
